hierarchie der proteinstruktur - schroderlab.org · glycine alanine valine leucine isoleucine...

Hierarchie der Proteinstruktur

Sekundärstruktur: α-Helix

Ausrichtung lokaler Dipolmomente stabilisiert zusätzlich:

Bändermodell(Cartoon)

Sekundärstruktur: β-Faltblatt

Bändermodell(Cartoon)

Ramachandran-Plot

beta-Faltblatt

alpha-Helix

Lalpha

linkshändige Helix: Lalpha

Ramachandran-Plot Statistik: Unterschiede zwischen Aminosäuren

Tertiärstruktur (Folds): Beispiele

α/β Domain, Rossmann fold

PDB 1HDC

Immunoglobulin Domain,

PDB 1AQK

TIM BarrelPDB 1YPI Jellyroll

PDB 2BUK

Quartärstruktur

Actin Filament

from Stryer, Biochemistry

from Stryer, Biochemistry

Glycine

Alanine

Valine

Leucine

Isoleucine

Proline

Methionine

Phenylalanine

Tryptophan

Serine

Threonine

Asparagine

Glutamine

Cysteine

Tyrosine

Aspartic Acid

Glutamic Acid

Lysine

Arginine

Histidine

unpolar polar negativ geladen

positiv geladen

from Stryer, Biochemistry

pKa - Werte