Beispiel 7:
DNA/RNA Strukturen
Die Doppelhelix als spezialisierter Legobaustein
nm-Abmessungen, Sequenzspezifität,Persistenzlänge ~50nm
regelmäßige Strukturen: DNAFeldkamp & Niemeyer, Angew. Chem. Int. Ed. 45: 1856 (2006)
SchleifeninduzierenBiegung
regelmäßige Strukturen: RNAChworos et al., Science 306: 2068 (2004)
RNA-Doppelhairpin-Quadrant als Puzzleteil
Verschmelzen durch langsames Abkühlen
30°C, 30min 50°C 4°C, 16h
3-dimensionale Strukturen
Goodman et al., Science 310: 1661 (2005)Shih et al., Nature 427: 618 (2004)
Aldaye & Sleiman, JACS 129: 13376 (2007)
beliebige Strukturen in 2D: DNA-Origami
7 kb lange virale Einzelstrang DNA + viele kurze (30 b) Helferstränge eindeutige Struktur
Rothemund, Nature 440: 297 (2006)
beliebige Strukturen in 2D: DNA-Origami
- hohe Flexibilität- hohe Ausbeute- kurze Abkühlzeit (75min)
Rothemund, Nature 440: 297 (2006)
beliebige Strukturen in 2D: DNA-Origami
Funktionalisierungenan Helfersträngen
Rothemund, Nature 440: 297 (2006)
zur RNA Detektion Probe
Ke et al., Science 319: 180 (2008)
zur Positionierung von - Quantendots- Goldpartikeln- Proteinen
weiterführende Infos
Synthetische Biologie Übersichtsartikel- Brenner & Sismour, Nat. Rev. Gen. 6: 533 (2005) - Drubin et al., Genes Dev. 21: 242 (2007)
Internationales SB Meetinghttp://www.syntheticbiology3.ethz.ch/index.htm
Wettbewerb iGEM 2006http://www.igem2006.com/
Ribosome EngineeringPeter Schultz Lab, http://schultz.scripps.edu/
Logische Biochemische NetzwerkeFritz Simmel Lab, TUMDieter Braun Lab, LMU
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