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Mechanismen der
Membranfusion
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Capsid (Protein)
Genom (Nukleinsäure)
Envelope (Hülle)
Nukleokapsid
Virion
VirionNukleokapsid
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Penetration
Rezeptorvermittelte Endozytose:
die meisten „nackten“ Viren (z.B. Picornaviren, Adenoviren)
einige umhüllte Viren (z.B. Influenzavirus, Flaviviren, Rhabdov.)
Virusstrukturprotein mit fusionsaktiver Sequenz
(meist durch absinkendem pH im Endosom aktiviert)
Fusion mit der Plasmamembran:
umhüllte Viren (z.B. Paramyxoviren, Herpesviren)
Verschmelzen der viralen und zellulären M direkt nach
Adsorption
Virales Fusionsproteine bei neutralem pH aktiv
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Rezeptorvermittelte EndozytoseBeispiel: Semliki Forest Virus
Clathrin-abhängige rezeptorvermittelte
Endozytose
Ansäuerung im frühen Endosom
Fusion der Virusmembran mit der
Endosomenmembran
Freisetzung des Nukleokapsids in das
Zytoplasma (bleibt mit Endosomen
assoziiert)
Disassembly des Nukleokapsids
Genexpression und Genomreplikation
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Phospholipid-Bilayer
Membranassoziierte Proteine
aussen: Sphinogmyelin
Phosphatidylcholin
Glykolipide
Cholesterin
innen: Phospatidylethanolamin
Phosphatidylserin
Phosphatidylinositol
Cholesterin
Integrale Membranproteine
(Transmembranproteine, meist
glykosyliert)
Periphere Membranproteine
Lipid-verankerte Proteine
Kohlenhydrate (Zucker)
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Physik der Membranfusion
Annäherung der Membranen
Destabilisierung der Hydrophoben-/Hydrophilen Grenzen
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Virushülle
Zellmembran
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Physik der Membranfusion
Membranporen
- Entstehen auch bei proteinfreien Liposomen
- Flackern von Poren : Dauer von nur wenigen
Millisekunden bis hin zu Sekunden
- Proteine können dem Auslösen sowie dem
Stabilisieren der Fusionsporen dienen
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Membranfusion
• zwei separate Lipiddoppelschichten verschmelzen
miteinander zu einer
zusammenhängenden
Lipiddoppelschicht
• Essentieller Prozess im Lebenszyklus von Zellen
– zB involviert in die regulierte Interaktion zwischen
intracellulären Membrankompartimenten, wie beim
Vesikeltransport oder der Exozytose
– Auch extrazelluläre Fusionsvorgänge wie während der
Spermium-Ei-Fusion oder Myoblastendifferenzierung sind
bekannt
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Zell-Zell Membranfusion
• Bei Befruchtung sowie Bildung der
Immunabwehr und Immunabwehr an sich
• Spermium-Oocyte-Fusion:
- nur wenig bekannt
- IZUMO mit Ig-like Domäne (Spermium)
- CD9 (cluster of differentiation) (Oocyte)
bewirken extremere Krümmungen
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Intrazelluläre Membranfusion
•Fusion wird von Protein-Maschinerie durchgeführt
•Außer SNAREs (membranverankert) alles aus dem
Cytoplasma rekrutiert
•Zwei Protein-Protein-Interaktionszyklen notwendig
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Intrazelluläre Membranfusion
• Membrananlagerung über Rab-GTPasen
• SNARE-Assemblierung durch Rab soluble N-ethylmaleimide-sensitive-factor attachment receptor
•Fusion durch SNARE und SM-Proteine
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SNARE-Zyklus
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Rab-Proteine
Rab-Proteine ->GTPasen (GDP-löslich; GTP-gebunden)
Vermittelt die Membrananlagerung (meistens)
Für jedes Kompartiment spezielle Rabs (+Kofaktoren)
Keine Transmembrandomäne (Geranylgeranylreste)
Jedes Rab besitzt einen eigenen Effektor
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Rab-Zyklus
Rab-GTP (membranst.)
-> Attachment
Nach/während Fusion
-> GTP zu GDP
-> Rab wird löslich
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Rab-Zyklus
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SNAREs und SM-Proteine
Freie SNARE-Motive sind unstrukturiert
Gebundene bilden 4-Helix-Bündel
Müssen auf beiden Membranen vorhanden sein
Bedeutender Kofaktor SM-Proteine
Einziger Fakt: SNAREs bringen die Membranen näher
aneinander, alles andere unbekannt
v-SNARE = vesicle synaptosome-associated protein receptor
t-SNARE = target synaptosome-associated protein receptor
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SNARE-Zyklus
b) Assemblierung der
SNARE-/SM Proteine
SNARE-Motive
noch unstrukturiert
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SNARE-Zyklus
c) trans-SNARE
Bndg.
-> 4x SNARE
trans
Komplex
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SNARE-Zyklus
d) Hemifusion nach
Tubulibildung
-> weitere Schritte
noch unklar
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SNARE-Zyklus
d) vollständige
Fusion
-> trans-Komplexe
werden zu cis
-> von NSF/SNAP
abgebaut
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Synaptische Vesikelfusion
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Virale Membranfusion
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Übersicht
• Membranfusion allgemein
• Klasse I-III – Fusionsproteine
• FAST-Proteine
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Membranfusion
• Zell-Zell-Fusion -> Synzytienbildung
– möglich durch zelluläre Proteine, wie zB. FF-Proteine oder
SNARE-Proteine
– bei umhüllten Viren durch Glykoproteine vermittelt
– bei nicht-umhüllten Viren: FAST-Proteine
– bedeutsam für cell-to-cell-spread, Virulenz und Persistenz
• Virus-Zell-Fusion
– durch Klasse I- III - Fusionsproteine bei umhüllten Viren
• KEINE Fusion durch bloßen Zell-Zell-Kontakt! Zelluläre oder virale Fusionsproteine nötig
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Klasse I, II und III –
Fusionsproteine bei umhüllten
Viren
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Fusionsproteine• Glykoproteine bestehen aus:
– eine große Ektodomäne
– Transmembrandomäne
– kurze cytoplasmatische Domäne
• Besonderheit: Fusionspeptid (kurze Sequenz hydrophober AS)
• Präfusionsformen sind metastabil
• whl. kinetische Barrieren vorhanden:
• Fusion durch Konformationsänderungen
zu niedrigeren Energiezustand ermöglichtHemifusion
Fusionspore
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Allgemeiner Werdegang der
Fusionsproteine:
1. Änderung in eine verlängerte Konformation, wobei das Fusionspeptid freigelegt wird
2. Insertion und Verankerung des Fusionspeptids in die gegenüberliegende Membran -> „Prehairpin“-Struktur
3. Rückfaltung -> „Hairpin“- Struktur
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Diversität von viralen Fusionsproteinen
und den Auslösern für die Fusion
(A) Influenza HA
(B) Paramyxovirus F und die meisten retroviralen Env Proteine
(C) α-retrovirale Env Proteine
(D) Ebola GP
(E) TBEV E
(F) VSV G
(G) HSV gB
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Klasse I
Beispiele Influenza -> HA
Paramyxovirus -> F
HIV -> gp41
Integraler Membrantyp Typ I
Lage der
Fusionspeptide
In der Nähe des N-
Terminus
proteolytische
Prozessierung
benötigt
Ja
Oligomerer Status der
nativen Form
Trimer
Oligomerer Status der
fusionsaktiven Form
Trimer
Sekundärstruktur der
fusogenen UE
α - Helix
Struktur der post-
Fusionsform
„hairpin“-Struktur
(„coiled-coil“,
6Helixbündel aus TM
+ Fusionspeptiden)
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Klasse I -Fusionsprotein
FP Fusionspeptid – lokalisiert am oder in der Nähe des N-Terminus
N-HR N-heptad repeat
C-HR C-heptad repeat
TMD Transmembrandomäne
Wellenlinie: Cytoplasmatischer Schwanz
// Linker mit variabler Länge
immer als Vorläuferproteine synthetisiert und später in zwei Polypeptide
gespalten
N-Terminus C-Terminus
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Influenzavirus Paramyxovirus
• Familie: Orthomyxoviridae
• - ssRNA, segmentiert
• umhüllt, 80-120 nm Durchmesser
• Fusionsprotein HA
• Trigger für Fusion: pH-Wert
• Ordnung: Mononegavirales
• Familie: Paramyxoviridae
• - ssRNA, linear
• umhüllt, 150 nm Durchmesser
• Fusionsprotein F
• Trigger für Fusion: Rezeptor
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Influenza HA
• HA0 (Vorläuferprotein) wird gespalten:
• HA1-Untereinheit
bindet an Sialinsäure auf der Zelloberfläche
internalisiert Endosomalen Weg
• HA2-Untereinheit
– für Fusion
• Fusion durch niedrigen pH im Endosom
HA0 HA1-UEHA2-UE
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• N-terminales Fusionspeptid
• bei pH - ↓:
– Bewegung der Rezeptor-
bindenden Kopfdomäne (HA1,
nicht in der Abb) wobei HA2
freigelegt wird
• Fusion durch:
– Verlängerung des
Fusionspeptids
Prehairpin-Intermediat
und C-terminale Umkehrung
Transmembrandomäne
(Dreiecke) in die Nähe des
Fusionspeptids
• finales Stadium: Hairpin-Struktur
Trimer Monomer Hairpin-Struktur
zentrale coiled-coilStruktur
unstruktur. Linker
unstruktur. Linker
Influenza HA
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Influenza HA
rb = Rezeptor-bindende Untereinheit
F = Fusionsuntereinheit
6HB = 6 Helixbündel
Zielmembran
virale Membran
10
-20
nm
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Rezeptorvermittelte Endozytose
Influenza: Ansäuerung des Kapsids durch viruskodierte
Ionenkanal (M1) führt zur Membranfusion
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Paramyxovirus F
• Fusion durch Rezeptorbindung
• separates Rezeptor-bindendes Protein: HN
• F0 (Vorläuferprotein) wird gespalten:
F1 und F2 (Disulfid-linked)
Fusionspeptid ursprünglich internal -> N-terminal in F1
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• drei Domänen
• Furin-Spaltungsstelle =
Start von F1 (roter Pfeil)
• N-terminales
Fusionspeptid im F1
Trimer Monomer
Paramyxovirus F
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Assoziations-Model
Dissoziations-Model
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• F-Protein mit drei Domänen
• DI und DII: primär aus β-Faltblatt +
Linkerstrukturen
• Furin-Spaltungsstelle = Start von F1 (roter
Pfeil)
• N-terminales Fusionspeptid – im Trimer
verkeilt zwischen DII und DIII
Trimer Monomer
• Hairpin-Struktur
• lange coiled-coil- Struktur
mit 6 Helixbündeln
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Klasse I Klasse II Klasse III
Beispiele Influenza -> HA
Paramyxovirus ->
F
HIV -> gp41
TBEV -> E
SFV -> E1/E2
VSV -> G
HSV-1 -> gB
Integraler
Membrantyp
Typ I Typ I Typ I
Lage der
Fusionspeptide
In der Nähe des N-
Terminus
Intern intern
proteolytische
Prozessierung
benötigt
Ja Ja Nein
Oligomerer Status
der nativen Form
Trimer Dimer Trimer bei VSV
Oligomerer Status
der fusionsaktiven
Form
Trimer Trimer Trimer
Sekundärstruktur
der fusogenen UE
α - Helix β - Faltblatt α - Helix
β - Faltblatt
Struktur der post-
Fusionsform
„hairpin“-Struktur
(„coiled-coil“,
6Helixbündel)
„hairpin“ – Struktur
(nicht- „coiled-coil“)
„hairpin“-Struktur
(bei VSV 6HB)
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Klasse II-Fusionsprotein
• Die Faltblätter sind miteinander verbunden und formen
eine ikosaedrische Struktur
• sind assoziert mit einem Chaperonprotein
– zB. p62 bei SFV E1 oder prM bei TMEV E
– die Spaltung erfolgt während oder kurz nach dem Virusassembly
• Trigger: niedriger pH-Wert
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TBEV
• Familie: Flaviviridae
• Gattung: Flavivirus
• Art: Tick-borne meningoencephalitis – Virus
• + ssRNA
• umhüllt, 40-60 nm Durchmesser
• Fusionsprotein: E
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TBEV E
• anti-parallele Homodimere
• 3 Domänen,
– D II mit Fusionspeptid-Loops
und ij-Loop (Rolle beim Binden
der Zielmembran)
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• Dimer
• Konformationsänderungen bei
niedrigen pH
Rotation fast des gesamten
Proteins
Bildung eines
homotrimerischen Pre-Hairpins
• Trimer
• Hairpin-Struktur
flexibler Linker
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Dimer Pre-Hairpin Hairpin (Trimer)
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Klasse I Klasse II Klasse III
Beispiele Influenza -> HA
Paramyxovirus ->
F
HIV -> gp41
TBEV -> E
SFV -> E1/E2
VSV -> G
HSV-1 -> gB
Integraler
Membrantyp
Typ I Typ I Typ I
Lage der
Fusionspeptide
In der Nähe des N-
Terminus
Intern Intern
proteolytische
Prozessierung
benötigt
Ja Ja Nein
Oligomerer Status
der nativen Form
Trimer Dimer Trimer bei VSV
Oligomerer Status
der fusionsaktiven
Form
Trimer Trimer Trimer
Sekundärstruktur
der fusogenen UE
α - Helix β - Faltblatt α - Helix
β - Faltblatt
Struktur der post-
Fusionsform
„hairpin“-Struktur
(„coiled-coil“,
6Helixbündel)
„hairpin“ – Struktur
(nicht- „coiled-coil“)
„hairpin“-Struktur
(bei VSV 6HB)
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Klasse III- Fusionsproteine
• Fusionspeptid: sehr kurz, nur wenige hydrophobe AS
und diskontinuierlich
• zweiteilige internale Fusionspeptide aus zwei starren
Loops aus drei antiparallelen β-Strängen
• Trigger: niedriger pH-Wert, Rezeptorbindung
• Besonderheit: Konformationsänderung durch den pH ist
reversibel
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VSV
• Ordnung: Mononegavirales
• Familie: Rhabdoviridae
• Gattung: Vesiculovirus
• Art: Vesicular stomatitis virus
• - ssRNA, linear
• umhüllt
• Fusionsprotein: G
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VSV G
• neutraler pH
• Fusionspeptid und TM am gl.
Ende lokalisiert
• Fusionloops offen liegend
• nach pH-↓: ähnliche
Konformationsänderungen wie
bei Influenza HA
• Hairpin-Struktur
unstruktur. Linker
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gD -> specific host-cell receptor
-> gD is activated
interaction with gH/gL and/or gB
-> core fusion complex
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Herpesvirus membrane fusion – a hypothesis
gD -> specific host-cell receptor
-> gD is activated
interaction with gH/gL and/or gB
-> core fusion complex
PM
VM
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FAST-Proteine
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FAST – Proteine - eine eigene
Klasse von Fusionsproteinen
• FAST = fusion-associated small transmembrane
• Familie: Reoviridae
Gattung: Orthoreovirus Aquareovirus
Spezies: Avian reovirus (ARV) Atlantic salmon reovirus
Nelson bay virus (NBV) (AtSRV)
Baboon reovirus (BRV)
Reptilian reovirus (RRV)
– Nicht-umhüllte Viren
– dsRNA, segmentiert
– ikosaedrisch
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Was sind FAST-Proteine?
• Nicht-Strukturproteine
– nicht beim Eintritt in die Zelle beteiligt !!!
– werden in infizierten Zellen exprimiert und über den
ER-Golgi-Weg an die Plasmamembran gebracht
• Akkumulierung der FAST-Proteine auf der
Zelloberfläche führt zur Fusion mit benachbarten
(nicht-infizierten) Zellen
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Merkmale der FAST-Proteine
• Kodiert durch ein
polycistronisches Segment
• kaum/keine direkten Sequenzhomologien
– ARV & NBV (33% gleich)
– RRV
– BRV
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Merkmale der FAST-Proteine
• Klein mit 95-140 AS (Fusionsproteine umhüllter Viren: 150-300 AS)
• Nexoplasmatisch/ Ccytoplasmatische räumliche Struktur in der Plasmamembran– damit ein Typ III – Membranprotein
– Typ I: Nexo/Ccyt; Typ II: Cexo/Ncyt
• basische Domäne
• Stück mit hydrophoben Resten– übernimmt evt. Funktion als Fusionspeptid
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Vergleich zu anderen
Fusionsproteinen
• keine „verlängerten“ heptad repeat -
Strukturen
– > keine coiled-coil Domänen
• kein typisches Fusionspeptid-Motiv
• keine langen, komplexen, multimere
Ektodomänen
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Modell des p10-Protein von ARV
und NBV
• hydrophobe Domäne mit kurzer heptad repeat - Struktur – einzige Ähnlichkeit zu Fusionspeptiden
evt. in „Membran-suchenden“ helikalen Konformation
• basische Domäne beeinflusst Membranorientierung
evt. auch Viroporin-ähnliche Membran-destabilisierende Aktivität
• konservierte Cystein-Reste in Cytoplasmatischen Domäne
evt. palmityliert ähnlich dem „Adenovirus death protein“
TM
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Abgrenzung von Viroporinen
FAST-Proteine
• nackte Viren
• 95-140 AS-Reste
• Nichtstrukturproteine
• basische Domäne
• für Synzytienbildung verantwortlich– löst Apoptose aus und
damit Virusfreisetzung
– keine Permeabilitätsveränderung der Membranen
Viroporine
• behüllte und nackte Viren
• 60-120 AS-Reste
• oft Nichtstrukturproteine
• polybasische Domänen
• Donormembran-störend– evt. mitwirkend am CPE und
an Freisetzung von Virionen
– Veränderung der Permeabilität der Membran zB. Ionentransport möglich
• zB bei Influenza M2
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FAST – Protein -
Fusionsmechanismus
• whl. keine größeren Konformationsänderungen möglich
• Hypothese: FAST-Proteine lösen indirekt eine Fusion
aus?
– Einsatz von Actionmycin D -> Wirtszelltranskription gestört
– kein Effekt auf Reovirustranskription oder Synzytienformation
• FAST-Proteine sind Fusionsproteine, die direkt zu einer
Fusion führen
• Hemifusions-Weg?
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![Page 72: Mechanismen der Membranfusion - lehre.fli.de · Rezeptorvermittelte Endozytose Beispiel: Semliki Forest Virus Clathrin-abhängige rezeptorvermittelte Endozytose Ansäuerung im frühen](https://reader030.vdokument.com/reader030/viewer/2022040701/5d5a23ab88c99367138ba9f2/html5/thumbnails/72.jpg)
It‘s good not all
can fuse !
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Sebastien Igonet and Felix Rey, Cell 151, December 21, 2012
![Page 74: Mechanismen der Membranfusion - lehre.fli.de · Rezeptorvermittelte Endozytose Beispiel: Semliki Forest Virus Clathrin-abhängige rezeptorvermittelte Endozytose Ansäuerung im frühen](https://reader030.vdokument.com/reader030/viewer/2022040701/5d5a23ab88c99367138ba9f2/html5/thumbnails/74.jpg)
Physik der Membranfusion
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Zell-Zell Membranfusion
• Vorhandensein von fusogenen Proteinen
die unabhängig von der intrazellulären
Fusion sind.
• Zwei verwandte Proteine (EFF-1 und AFF-
1) werden
hauptsächlich für die epitheliale Zellfusion
benötigt.
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Zell-Zell Membranfusion
• EFF-1 ist selbstoligomerisierend und
bindet sich in trans, wenn in beiden F.-
Partnern vorhanden.
• EFF-1 vermittelt die Fusion direkt und wird
am Kontaktpunkt angereichert.
• Auch alleine schon fusogene
Eigenschaften -> Syncytienbildung
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SNAREs und SM-Proteine
SNARE-Komplex besteht meist aus Qa-,
Qb-, Qc-,
und R-SNAREs
Wichtigster Bestandteil: SNARE-Motiv (4x α-
Helices)
Besitzen Transmembrandomäne
(Ausnahmen!)
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Synaptische Vesikelfusion
Regulation der Vesikelausschüttung über
Ca²+
Nur in aktiven Zone ausgelöst (präsyn.
Spalt)
Verzögerungszeit von >1ms evtl. >100µs
Vesikelausschüttung nahezu synchron
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Synaptische Vesikelfusion
Reaktionszeit legt nahe dass :
- Fusionsprozess zuvor bereits
stattfand (z.T.)
(SNARE-Assemblierung, Hemifusion,
…)
- aktive Zonen besitzen große
unlösliche
Proteinkomplexe
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Literatur
• Corcoran, J. A. and R. Duncan (2004). "Reptilian reovirus utilizes a small type III protein with an
external myristylated amino terminus to mediate cell-cell fusion." J Virol 78(8): 4342-4351.
• Harrison, S. C. (2008). "Viral membrane fusion." Nat Struct Mol Biol 15(7): 690-698.
• Racine, T., T. Hurst, et al. (2009). "Aquareovirus effects syncytiogenesis by using a novel member
of the FAST protein family translated from a noncanonical translation start site." J Virol 83(11):
5951-5955.
• Salsman, J., D. Top, et al. (2005). "Extensive syncytium formation mediated by the reovirus FAST
proteins triggers apoptosis-induced membrane instability." J Virol 79(13): 8090-8100.
• Sapir, A., O. Avinoam, et al. (2008). "Viral and developmental cell fusion mechanisms:
conservation and divergence." Dev Cell 14(1): 11-21.
• Shmulevitz, M. and R. Duncan (2000). "A new class of fusion-associated small transmembrane
(FAST) proteins encoded by the non-enveloped fusogenic reoviruses." EMBO J 19(5): 902-912.
• Wessels, L. and K. Weninger (2009). "Physical aspects of viral membrane fusion."
ScientificWorldJournal 9: 764-780.
• White, J. M., S. E. Delos, et al. (2008). "Structures and mechanisms of viral membrane fusion
proteins: multiple variations on a common theme." Crit Rev Biochem Mol Biol 43(3): 189-219.
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HIV Attachment und Penetration
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SNAREs und SM-Proteine
Brücke zwischen Rab-Zyklus und SNARE-Komplexen sind
die SM-Proteine (vermutlich)
SM-Proteine sind essentiell (SNAREs nicht unbedingt)
Regulieren die SNARE-Assemblierung a.d. Membran
Verhindern SNARE-Fehlpaarungen
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Synaptische Vesikelfusion
Ca²+ Sensor (Synaptotagmin 1) sitzt an Exocyt.seite
Mehrere Ca²+ binden an einen Sensor
Fungiert als zurückhaltende Fusionsklammer
Oft Ziel von Neurotoxinen (Botulinus, Tetanus Toxin)
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Membranfusion
Sekretorischer Weg:
Rab GTPasen, SNAREs,
SNARE-assoziierte Proteine (SM, NSF, SNAP
…)
Arbeiten mit speziellen Lipiden zusammen um die
Fusion auszulösen.