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Molekulargenetik der EukaryotenWS 2014/15, VL 13
Erwin R. Schmidt
Institut für Molekulargenetik
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Splicing (Spleißen)wichtiger Teil der RNA-Prozessierung; die Intronabschschnitte werden aus dem Primärtranskript entfernt
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Je nach Spleißmechanismus werden vier verschiedene Gruppen von Introns unterschieden:
• tRNA Introns
• Autokatalytische Introns Gruppe I
• Autokatalytische Introns Gruppe II
• hn-/mRNA Introns
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tRNA Splicing:= zwei Stufenprozess
1. Herausschneiden des Introns durch Endonuklease
2. Verknüpfen der Exons durch RNA-Ligase
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Autokatalytisches SplicingRibozyme
Beim autokatalytischen Spleißen sorgt die Intron-
RNA selbst (autokatalytisch) dafür, dass die RNA an
den Intron-Exon-Grenzen geschnitten und die beiden
Exon-Enden (3´-Ende von Exon n mit dem 5´-Ende von Exon m) über
eine Phosphodiesterbindung
verknüpft werden. Weil die RNA bei diesem Prozess
wie ein Enzym katalytisch aktiv ist, werden diese
RNAs auch als Ribozyme bezeichnet
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Ribozym-Struktur
Entdecker der Ribozyme
Th. R. Cech; Sydney Altman
Nobelpreis 1989
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Autokatalytisches Spleißen der Gruppe I Introns
bei Prä-rRNA von Tetrahymena
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Mechanismus der autokatalytisch spleißenden Gruppe I Introns
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Autokatalytisches Splicing Gruppe II Introns
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mRNA-Spleißenan der „Consensus Splice Site“ /GU...A..AG/
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Beim Spleißen bildet sich ein „Lariat“ im heraus gelösten Intron über eine 2´-5´Phospho-diesterbindung
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Am Spleißen von mRNAs sind Spliceosomenmit „SN(U)RPS“ beteiligt
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snRNPs (SNURPS) enthalten diesnRNAs (sn= „small nuclear“)U1, U2, U4/6 und U5
(snRNPs= small nuclear ribonucleoprotein)
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Zeitliche Abfolge
der Vorgänge
am Spliceosom
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Zusammenfassung
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Warum überhaupt Introns?
• Erleichtern die Enstehung komplexer Gene!• (mehrere Minigene = Exons werden zu Makrogene zusammengepackt)
• „Exon shuffling“ • (einzelne Exons kodieren für Proteindomämen )“Module“, verschiedene Module ergeben
zusammen immer wieder neue Proteine)
• Alternatives Spleißen• (durch Kombination verschiedener Exons auf Ebene der RNA kann ein Gen für viele Proteine
kodieren)
• Transspleißen
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Prinzip des alternativen Spleißens
Intron retention
Exon skipping
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Alternatives oder differenzielles Spleißen erhöht die Zahl der Proteine>70% unserer Gene sollen alternative Spleißprodukte bilden!Modrek, B. and C. Lee, 2002, 'A genomic view of alternative splicing', Nature Genetics,30: 13-19.
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Alternatives Spleißen bestimmt bei Drosophila melanogaster das Geschlecht
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Alternatives Spleißen bestimmt bei Drosophila melanogaster das Geschlecht
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Beim DSCAM-Gen (115 Exons) gibt es bis zu 38.016 verschiedene Spleißvarianten
Besteht immer aus 24 Exons,
aber A, B, C, D sind variabel
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Ebenen der Chromosomen-organisation und der Chromatinstruktur
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In Metaphasechromosomen ist die DNA in Schleifenform in einer Matrix/einem Scaffold verankert (Paulsen und Laemmli, 1977)
Histone-depleted chromosomes consist of a protein scaffold to which loops of DNA are anchored. Photograph kindly provided by Ulrich K. Laemmli
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Elektrophoretische Auftrennung von DNA nach Verdau von Chromatin mit Nuclease
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Chromatin Struktur und Funktion: das Nukleosom
X-ray crystal structure of the nucleosome core particle from Luger, K.; Mader, A. W.; Richmond, R. K.; Sargent, D. F.; Richmond, T. J., "Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 Angstrom resolution," Nature 1997, 389, 251–260.