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Internetadressen
Im Folgenden werden wichtige Internetadressen alphabetisch aufgeführt. Dazu gehören Hersteller und Bezugsquellen von Feinchemikalien, mikrobio-logischen Materialien, Antikörpern und Reagenzien. Außerdem sind Stamm-sammlungen für den Bezug von Organismen, Plasmiden und Viren sowie Internetportale und Datenbanken für Nukleinsäure- und Proteinsequenzen aufgeführt.
Hersteller und Bezugsquellen
Amersham Buchler (www.amershamhealth.de) Radiochemikalien.
Amersham Biosciences (www.amershambiosciences.com) Biochemikalien.
BD Biosciences Clontech (www.bdbiosciences.com/clonetech/) Difco Nährboden-medien.
Bio-Rad (www.bio-rad.com) Elektrophoresegeräte, Spannungsgeber, Elektropora-tion.
Biozym Diagnostik (www.biozym.com) Spezialagarosen, PCR Geräte.
Calbiochem (www.merckbiosciences.co.uk/html/CBC/home.html) Hygromycin, Inhibitoren.
Eppendorf (www.eppendorf.de) Probenaufbereitung, Molekularbiologische Sys-teme, Zentrifugen, PCR.
Gilson (www.gilson.com) Mikroliterpipetten.
Hybridoma Bank (www.uiowa.edu/~dshbwww/) monoklonale Antikörper gegen verschiedenste Proteine, unter anderem Drosophila melanogaster.
Invitrogen (www.invitrogen.com) Produkte für DNA-Analysen, Proteinchemie, Klonierung, Sequenzierung, Transfektion.
Osram Sylvania (www.sylvania.com) Wolfram- und Wolframcarbid-Pulver.
Promega (www.promega.com) Produkte zur Untersuchung von Gen-, Protein- und zellulären Prozessen.
Internetadressen 397
Qiagen (www.qiagen.com) Kits für DNA-, RNA- und Plasmid-Aufreinigung.
Roche (www.roche-applied-science.com) Enzyme, Biochemikalien, funktionelle Genomic- und Proteomic-Analysen.
Schleicher & Schuell (www.schleicher-schuell.de) Filtration, Blotting- und Trans-fermembranen.
Serva (www.serva.de) Biochemikalien, Elektrophoresegeräte, Spannungsgeber.
Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com) Biochemikalien, Feinchemikalien.
Stratagene (www.stratagene.com) kompetente Zellen, Vektoren, Toxikologie und Zellbiologie.
Stammsammlungen
ATCC (American Type Culture Collection) (www.atcc.org) Organisation befasst sich mit der Systematik, Charakterisierung, Konservierung und dem Vertrieb von Bakterien, Archaea, Pilzen, Plasmiden, verschiedenen Viren sowie diversen Zelllinien.
Bloomington Drosophila Stock Center (fl ystocks.bio.indiana.edu) Stammsamm-lung zu verschiedenen D.-melanogaster-Mutanten.
DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH) (www.dsmz.de) Organisation befasst sich mit der Systematik, Charakterisierung, Konservierung und dem Vertrieb von Bakterien, Archaea, Pilzen, Plasmiden, verschiedenen Viren sowie diversen Zelllinien.
NCCB (Netherlands Culture Collection of Bacteria) (www.cbs.knaw.nl/NCCB/). Hier sind neben 4500 Wildtyp-Bakterienstämmen 5000 bakterielle Mutanten und 600 Phagen erhältlich. Es werden zudem über 450 Klonierungsvektoren angeboten.
YGRRC (Yeast Genetic Research Resource Center) (www.lgcpromochem-atcc.com/SearchCatalogs/YGRRC.cfm) 25 000 Hefestämme, 400 Hefevektoren, 2000 yeast artifi cial chromosomes (YACs) und 20 Genom- und cDNA-Banken.
Internetportale, Datenbanken und Programme
Berkeley Drosophila Genome Project (www.fruitfl y.org) Datenbanken zum Dro-sophila-Genom.
Broad Institute (www.broad.mit.edu/annotation/fungi/neurospora/index.html) Serviceleistungen und Datenbanken zum Neurospora-crassa-Genom.
Chlamydomonas Genome Portal (www.jgi.doe.gov/chlamy/) DNA-Sequenzdaten-bank zum Clamydomonas-Genom-Projekt.
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Cloning Vector Collection (gillnet.lab.nig.ac.jp/cgi-bin/accvec_bro.pl) 386 E. coli Vektoren für unterschiedlichste Applikationen.
EBI (European Bioinformatics Institute) (www.ebi.ac.uk/clustalw/index.html).
Emboss (European Molecular Biology Open Software Suite) (mammoth.bii.a-star.edu.sg/emboss/index.html).
EUROSCARF (European Saccharomyces cerevisiae Archive for Functional Analysis) (www.uni-frankfurt.de/fb15/mikro/euroscarf/index.html) Datenbank zu Hefe-deletionsmutanten und Hefedeletionsplasmiden.
ExPASy (Expert Protein Analysis System) Proteomics Server (us.expasy.org, us.expasy.org/ch2d/ch2d-top.html) Datenbank zur Auswertung von Proteom-Analysen.
FlyBase (fl ybase.net) DNA-Sequenzdatenbank von Drosophila melanogaster.
FlyMove (fl ymove.uni-muenster.de) Datenbank zur Embryogenese von Drosophila melanogaster.
Fungal Genetics Stock Center (www.fgsc.net) Informationsseite, die sehr viele Datenbanken mit Sequenzen von Hyphenpilzen miteinander verknüpft. Darü-ber hinaus werden weitere wichtige genetische Daten zu Hyphenpilzen angebo-ten.
Indigo (indigo.genetique.uvsq.fr) E.-coli- und B.-subtilis-Gen-Informationen zum codon usage, zu benachbarten Genen inklusive funktioneller Klassifi kation, zu Stoffwechselwegen und Operons sowie Literatur und bibliografi sche Daten.
Interactive Fly (sdb.bio.purdue.edu/fl y/aimain/1aahome.htm) Datenbank zu Gen-funktionen von Drosophila melanogaster.
JCM (Japan Collection of Microorganisms) (www.jcm.riken.go.jp) bietet eine große Sammlung von Mikroorganismen; derzeit sind 4300 Bakterien-, 200 Archaea- und 2700 Pilz- bzw. Hefestämme erhältlich.
LALIGN (www.ch.embnet.org/software/LALIGN_form.html) Sequenzvergleich-sprogramm.
MIPS Comprehensive Yeast Genome Database (CYGD) (mips.gsf.de/genre/proj/yeast/index.jsp) Karten zum Hefegenom, Gen- und Proteinsequenzen, Hinweise zur Genfunktion und Literaturhinweise des Munich Information Center for Protein Sequences.
NCBI-Datenbank GenBank (www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/).
Pedant (Protein Extraction, Description and Analysis Tool) (pedant.gsf.de), umfasst bislang 287 vollständige und unvollständige Genome von Eubakterien, Archaea und Eukaryoten und bietet Analysemöglichkeiten für Proteinsequenzen, Vor-hersagen für Funktionen und Protein-Protein-Interaktionen.
Plasmid Genome Database (www.genomics.ceh.ac.uk/plasmiddb/) biologische Daten und Sequenzen aller bakteriellen Plasmide.
Internetadressen 399
DGRC (Drosophila Genomics Resource Center) (dgrc.cgb.indiana.edu) Bezugs-quelle für cDNA-Sequenzen, Vektoren usw.
SGD (Saccharomyces Genome Datenbank) (www.yeastgenome.org) Sequenzverglei-che sind möglich.
SMD (Stanford Microarray Database) (genome-www5.stanford.edu) gibt einen Überblick über Transkriptom-Analysen.
TAIR (The Arabidopsis Information Resource) (arabidopsis.org) Umfangreiche Informationsseite zu verschiedenen Datenbanken zum Arabidopsis-thaliana-Genom.
The Chlamydomonas Genetics center (www.biology.duke.edu/chlamy/) Verschie-dene Datenbanken zur Genetik von Chlamydomonas; darüber hinaus werden weitere Hintergrundinformationen zur C.-reinhardtii-Genetik gegeben.
The Neurospora Genome Project at the University of New Mexico (biology.unm.edu/biology/ngp/home.html) verschiedene Datenbanken zum Neurospora-Genomprojekt.
TIGR-Institut (The Institute for Genomic Research) (www.tigr.org) Sammlung vollständig sequenzierter pro- und eukaryotischer Genome auf der CMR-Hauptseite (Comprehensive Microbial Resource, www.tigr.org/tigr-scripts/CMR2/CMRHomePage.spl).
University of Oklahoma Neurospora crassa cDNA Blast Server (www.genome.ou.edu/nc_both_blast.html) BLAST-Vergleiche im FASTA-Format gegen Neu-rospora-crassa-Sequenzen.
VectorDB (seq.yeastgenome.org/vectordb/) Sequenzinformationen und Annotatio-nen zu mehr als 2600 Vektoren für verschiedene Organismen.
WDCM (World Database Collection for Microorganisms) (wdcm.nig.ac.jp) Umfas-sendes Netzwerk zwischen Stammsammlungen und Nutzern; mittels dieses Datenbank-Kompendiums können Informationen zur Verfügbarkeit unter-schiedlicher Mikroorganismen weltweit erhalten werden.
Yeast gfp fusion localization database (yeastgfp.ucsf.edu) Daten zu Fusions-proteinen, bei denen das gfp-Gen (green fl uorescent protein) mit nahezu allen Genen des Hefegenoms fusioniert wurde.
Glossar
Alignment Putativ homologe Nuklein- bzw. Aminosäuresequenzen werden so untereinander angeordnet, dass gleiche oder ähnliche Nukleotide bzw. Ami-nosäuren untereinander stehen. Beim lokalen Alignment wird in den unter-suchten Sequenzen nach Blöcken mit hoher Ähnlichkeit gesucht, und diese Blöcke werden dann getrennt dargestellt. Beim globalen Alignment wird die vollständige Suchsequenz im Vergleich mit ähnlichen Sequenzen dargestellt und im Fall von nicht-übereinstimmenden Bereichen werden Lücken gelassen. Alignments können mit zwei Sequenzen erfolgen oder mit mehreren Sequen-zen ( multiple Alignments).
Allel Zustandsform eines Gens an einem bestimmten Genort.
Allel-Klassifi zierungen• amorph Kompletter Funktionsverlust eines Gens, loss of function. Der Phä-
notyp homozygoter Tiere ist identisch zu Tieren, die heterozygot für ein amorphes → Allel und die Defi zienz des Gens sind.
• hypomorph Partieller Funktionsverlust eines Gens. Über einer Defi zienz wird der Phänotyp verstärkt.
• hypermorph Verstärkte Funktion eines Gens. Über einer Defi zienz wird der Phänotyp abgeschwächt.
• neomorph Gewinn einer neuen Funktion, gain of function, der Phänotyp prägt sich auch über einer Duplikation des Gens aus.
• antimorph Die Mutation wirkt entgegengesetzt zur normalen Funktion. Sie wirkt als dominant negativ. Über einer Duplikation wird der Phäno-typ abgeschwächt.
Annotation von Nukleinsäuresequenzen Bei der Annotation wird versucht, bestimmten Sequenzabschnitten ihre mögliche biologische Bedeutung zuzu-ordnen. Dies beinhaltet z. B. die Ermittlung von transkribierten Sequenzen, proteinkodierenden Sequenzen und Exon-Intron-Grenzen.
402 Glossar
Ascosporen Meiosporen, die bei vielen Ascomyceten schwarz und dickwandig sind und primär einen Kern enthalten.
Ascus Meiosporangium, das im Verlaufe der sexuellen Vermehrung bei Asco-myceten nach Fusion zweier Kerne (Karyogamie) entsteht. Bei vielen Schlauch-pilzen ist der Ascus ein schmaler Beutel, in dem die Ascosporen linear angeordnet sind und die Vorgänge im Verlaufe der Meiose widerspiegeln.
Auxotrophie Eigenschaft von Stämmen (Mikroben), die nur auf Nährme-dien wachsen, denen nicht synthetisierbare Substanzen zugesetzt wurden.
Balancer Spezielle Chromosomen bei Drosophila zum stabilen Halten von Stämmen; Balancer stabilisieren nicht alle Bereiche des Chromosoms gleich
gut.
Basidie Meiosporangium von Basidiomyceten.
Coenocyt Vielkerniges komplexes Cytoplasma bei Hyphenpilzen.
Chromosomen-Mutationen Mutationen, die Bereiche eines oder mehrerer Chromosomen betreffen. Drosophila: Bei den in eckigen Klammern ange-gebenen Abkürzungen steht n für den betroffenen Chromosomenarm z. B. 3L: 3. Chromosom, linker Arm.
• Defi zienz (auch Deletion genannt) [Df(n)Name] Man kann interne und terminale Defi zienzen unterscheiden. Durch die
Kreuzung von sogenannten überlappenden Defi zienzen kann man Gene auf dem Chromosom lokalisieren. Defi zienz-Chromosomen haben erstmals eine Korrelation zwischen genetischen und physikalischen Chromosomen-karten erlaubt.
• Duplikation [Dp(n)Name] Duplikationen entstehen nach dem reziproken Austausch von nicht-homo-
logen Chromosomenabschnitten zwischen homologen Chromosomen. Als reziprokes Ereignis entsteht hierbei immer ein Defi zienzchromosom.
• Inversion [In(n)Name] Eine Inversion entsteht nach einer Schleifenbildung durch ein illegitimes
intrachromosomales Crossing-over. In diesem Bereich ist die Abfolge der Gene invertiert. Eine Inversion zeigt ein besonderes Verhalten in der Meiose: Während der Meiose paaren sich die homologen Chromosomen, um die Rekombination zu ermöglichen. Wenn ein Inversionschromosom mit einem Wildtyp-Chromosom eine Synapse eingeht, bildet sich eine Schleife aus.
Glossar 403
Wenn es zu einer Rekombination in dem Bereich zwischen Rekombinations-schleife und Centromer kommt, wird nach der Anaphase 1 das Chromosom zerrissen. Inversionschromosomen eliminieren also Rekombinationspro-dukte. Sie bilden daher die Grundlage für einen wichtigen weiteren Chro-mosomentyp: das Balancer-Chromosom. Diese Spezialchromosomen, die bislang nur bei Drosophila etabliert wurden, erlauben die stabile Haltung von Mutationen.
• Ring-Chromosom [R(n)Name] Entstehen durch illegitimes intrachromosomales Crossing-over mit dem
Centromer in der vorliegenden Schleife oder durch Verkleben der Enden des Chromosoms. Das Ring-X-Chromosom wird bei der Produktion von
Gynandern eingesetzt.
• Transposition [Tp(n;m)Name] Wenn ein Chromosomenabschnitt von einem Chromosom auf ein ande-
res transponiert, ohne dass es zu einem reziproken Austausch wie bei der Translokation kommt, sprechen wir von einer interchromosomalen
Transposition. Sind die beteiligten Chromosomen homolog, entsteht eine Duplikation. Transpositionen führen bei Segregation der Chromoso-
men — ähnlich wie bei der Translokation — zu Defi zienz und Dup-likation. Transpositionen können auch intrachromosomal stattfi nden, es kommt dann zur Veränderung der Reihenfolge der Gene auf dem Chromo-som. Die Reihenfolge n;m gibt die Transpositionsrichtung an.
• Translokation [T(n;m)Name] Austausch von DNA durch illegitimes Crossing-over zwischen nicht-
homologen Chromosomen. Teile eines Chromosoms sind mit einem anderen nicht-homologen Chromosom verbunden und werden mit diesem vererbt. Die beteiligten Chromosomenarme n und m, von denen das ausgetauschte Material stammt, werden in aufsteigender Reihenfolge gelistet. Bei Segre-gation in Genotypen mit normalen Chromosomen resultieren gleichzeitig Duplikationen und Defi zienzen.
Crossing-over Austausch von Chromatiden, der zytologisch als Chiasma erkennbar ist und zur Rekombination führt. Bei Eukaryoten durch Bruch und Wiedervereinigung erfolgter Stückaustausch zwischen gepaarten homologen Chromosomen, der in der Prophase der ersten meiotischen Teilung abläuft. Illegitimes Crossing-over bezeichnet den Prozess einer intrachromosoma-len Rekombination, der je nach Orientierung der beteiligten Sequenzen zu verschiedenen Chromosomen-Mutationen führen kann. Zwischen zwei nicht-homologen Chromosomen führt das illegitime Crossing-over häufi g zu Translokationen.
404 Glossar
Defi zienz Chromosomen-Mutationen
Deletion Chromosomen-Mutationen
Duplikation Chromosomen-Mutationen
dominant Phänotyp zeigt sich in heterozygoten eukaryotischen Organismen.
DTS-Allele Es gibt einige wenige dominant temperatursensitive Letal-Mutationen; sie führen zum Absterben des Trägers bei höherer Temperatur (unterschiedlich empfi ndliche Entwicklungsphasen).
ektopische Integration Integration von transformierender (Fremd-)DNA an beliebiger Stelle im Rezipientengenom.
Endosymbiontentheorie Die Endosymbiontentheorie besagt, dass die Orga-nellen einer eukaryotischen Zelle phylogenetisch von ehemals freilebenden Prokaryoten abstammen.
Epistasie beschreibt die Interaktion zwischen nicht-allelen Genen. Wenn der Phänotyp einer Doppelmutante dem Phänotyp einer der Einzelmutanten ent-spricht, ist diese Mutation epistatisch gegenüber der zweiten Mutation.
EST (expressed sequence tag) ESTs sind ansequenzierte cDNA-Klone.
E (expect)-Wert Der E-Wert ist ein Maß für die Wahrscheinlichkeit, dass das erhaltene Ergebnis eines Sequenzvergleichs (z. B. mit BLAST) zufällig zustande kam. Je kleiner der E-Wert, desto signifi kanter ist das Ergebnis. Der kleinste mögliche E-Wert ist 0. Der E-Wert hängt von der Länge der Überein-stimmung zwischen den Sequenzen, der Länge der Suchsequenz und der Zahl der Nukleotide oder Aminosäuren in der Datenbank ab.
FLP/FRT-System Rekombinationssystem aus der Hefe. Die Flipase (FLP) ist ein Enzym, das an einer defi nierten Sequenz (FRT) angreift und Rekombina-tion mit hoher Effi zienz induziert.
functional genomics Parallele Untersuchung der Expression vieler oder aller Gene eines Organismus.
Glossar 405
Gynander Tiere, die sowohl männlich als auch weiblich determinierte Zellen aufweisen.
Halo Durchscheinender Ring (Hof), der sich auf einer Agarplatte um eine Kolonie herum bildet, wenn beispielsweise Nährstoffe abgebaut werden, oder Zellen nicht wachsen.
hcf (high chlorophyll fl uorescence)-Phänotyp Photosynthetische Mutanten zeichnen sich durch einen hcf-Phänotyp aus, der durch einen gestörten photo-synthetischen Elektronenfl uss in der Thylakoidmembran hervorgerufen wird.
Hefen Einzellig wachsende Pilze, die sich im Verlaufe der asexuellen Vermeh-rung durch Sprossung oder Spaltung vermehren.
Heterokaryon Ein Myzel, dass zwei oder mehrere genetisch verschiedene Kerne enthält.
Heterothallismus Die sexuelle Fertilität wird durch Kreuzungstyploci (mating type loci) kontrolliert. Bei Neurospora crassa z. B. gibt es zwei Kreu-zungstypen (A und a) und der Sexualzyklus kann nur nach Kreuzung von zwei Elternstämmen mit entgegengesetztem Kreuzungstyp-Locus vervollständigt werden.
Homokaryon Ein Myzel mit genetisch gleichen Kernen.
Homologie Evolutionäre Verwandtschaft. Zwei homologe Gene oder Proteine haben sich aus einer gemeinsamen Vorläufersequenz entwickelt. Man unter-scheidet dabei zwischen orthologen und paralogen Genen. Orthologe Gene wurden durch Artentstehung getrennt, paraloge Gene durch Genduplikation.
Homoplasmie Zustand, bei dem alle Kopien des Genoms von Chloroplasten bzw. Mitochondrien genetisch identisch sind. Liegen genetisch verschiedene Genome innerhalb einer Zelle vor, so spricht man von Heteroplasmie.
Homothallismus Homothallische Organismen sind zur Selbstung befähigt, d. h. der Sexualzyklus kann vervollständigt werden, ohne dass zwei Partner am Sexualprozess beteiligt sind.
Hybrid Dysgenese Es gibt Drosophila-Stämme, die transponierende geneti-sche Elemente tragen (P-Cytotyp). In der Regel wird in dem transponierenden
406 Glossar
Element die Transposase kodiert, die für die Mobilität dieser Elemente verant-wortlich ist. Die Transpositionsrate und die Zahl der Transposons einer Art sind genetisch streng reguliert. Kreuzt man einen Stamm, der Transposons trägt, mit einem Stamm, der keine Transposons trägt (M-Cytotyp), kommt es zur vermehrten Transposition. Die Nachkommenschaft weist eine erhöhte Mutationsrate auf.
Hyphen Filamentös wachsende Zellen der Hyphenpilze, die von einander durch Septen getrennt sind.
intrafl agellarer Transport (IFT) IFT ist notwendig für die Assemblierung von Geißeln und besteht aus einer bidirektionellen Bewegung von Protein-Komplexen entlang des Geißel-Axonems.
Interferenz Erscheinung, dass durch ein Crossing-over ein weiteres unter-drückt (positive Interferenz) oder gefördert (negative Interferenz) wird. Die Folge ist eine Rekombinationshäufi gkeit zwischen zwei Genen, die von dem zufälligen, theoretisch zu erwartenden Wert abweicht.
Inversion Chromosomen-Mutationen
Kernmatrix Proteinskelett des Kerns.
Konidien Asexuelle Sporen, die idR. ein bis mehrere Kerne enthalten. Sie sind das Produkt von Mitosen und werden oft am Ende der Hyphenspitzen durch Abschnürung gebildet.
Kopplungsgruppe Entspricht einem Chromosom. Die Gene dieses Chro-mosoms sind gekoppelt und nicht zufällig rekombinierbar. Durch Cros-sing-over oder Rekombination kann eine Neukombination der Allele eines Chromosoms erfolgen.
Kreuzungstyp Bei vielen Organismen lassen sich die Gameten, obschon mor-phologisch nicht unterscheidbar, entsprechend ihrer physiologischen Reaktion (Fusionsfähigkeit) in zwei Gruppen einteilen, die man im Allgemeinen mit „+“und „–“ bezeichnet. Eine sexuelle Reaktion fi ndet nur in der Kombination + × – statt. Da den Gameten weibliche oder männliche Geschlechtsmerkmale fehlen, ist eine Zuordnung der beiden polar reagierenden Gruppen zu einem Geschlecht nicht möglich. Man verwendet zur Bezeichnung der Gruppen den Ausdruck „Kreuzungstyp“ (+Kreuzungstyp; –Kreuzungstyp).
Glossar 407
letal Bezeichnet Allele, die zum Absterben des Organismus vor Vollendung des Lebenszyklus führen. Bei Diplonten sind homozygote Individuen nicht lebensfähig. Bei Drosophila: Homozygote Individuen sterben vor dem Schlüp-fen aus der Puppe.• embryonal-letal Bei Drosophila: Embryonen sterben vor dem Schlüpfen
aus den Eiern.• larval-letal Bei Drosophila: Larven sterben vor der Verpuppung.
Matrix Die Matrix legt fest, wie bestimmte Aminosäureaustausche bei Sequenz-vergleichen, z. B. mit BLAST, bewertet werden. Bei homologen Sequenzen, die ja eine evolutive Verwandtschaft aufweisen, ist der Austausch von Aminosäu-ren nicht zufällig, sondern die Wahrscheinlichkeit für einen konservierten Austausch ist deutlich höher als ein nicht-konservierter Austausch. Umgekehrt kann man also etwas vereinfacht schließen, dass zwei Sequenzen mit vielen konservierten Austauschen enger verwandt sind als zwei Sequenzen mit vielen nicht-konservierten Austauschen. Es wurden verschiedene Matrizen entwik-kelt, in denen jedem Aminosäurepaar ein bestimmter Zahlenwert zugeordnet wird, der in die Berechnung des sogenannten Score eingeht.
Myzel Gesamtheit der Zellen von Hefen oder Hyphenpilzen.
Partikelkanone Mit Hilfe einer Partikelkanone werden kleine, mit DNA beladene Wolfram-Partikel in Zellen geschossen. Diese biolistische Methode dient insbesondere der Transformation von Organellen.
PCR Polymerasekettenreaktion
permissive Bedingungen Umweltbedingungen, unter denen eine konditio-nale Mutante den Wildtyp-Phänotyp ausprägt.
Pheromon In der Regel fl üchtiger Lockstoff für Gameten.
Polymerasekettenreaktion (PCR, polymerase chain reaction) Die Poly-merasekettenreaktion ist ein in-vitro-Verfahren zur selektiven Anreicherung von defi nierten Nukleinsäurebereichen aus einem Nukleinsäuregemisch. Siehe auch Reverse-Transkription-PCR und Real-Time-PCR.
Postreduktion Trennung von Schwesterchromatidabschnitten schon wäh-rend der ersten Reduktionsteilung, d. h. die beiden → Allele an einem hetero-
408 Glossar
zygoten Locus (Aa) trennen sich erst während der zweiten Reduktionsteilung. Beispiel: in einem Ascus mit vier Ascosporen wäre die Allelenverteilung alternierend A, a, A, a.
Präreduktion Trennung der homologen Chromosomen und somit auch der beiden → Allele eines heterozygoten Locus (Aa) während der ersten Redukti-onsteilung. In einem Ascus mit vier Ascosporen wäre die Allelenvertei-lung A, A, a, a.
Promotor Funktionaler Abschnitt eines Gens, der die transkriptionelle Expres-sion durch die RNA-Polymerase initiiert. 35S-Promotor: Promotor des pfl an-zenpathogenen Blumenkohl-Mosaik-Virus (CaMV, caulifl ower mosaic virus), der von der pfl anzlichen RNA-Polymerase II erkannt wird und zur Transkrip-tion einer viralen polycistronischen 35S-RNA in den infi zierten Pfl anzenzellen führt. Der 35S-Promotor enthält Bindungsstellen für verschiedene pfl anzliche Transkriptionsfaktoren, so dass er in nahezu jedem Pfl anzengewebe zu einer starken Expression der von ihm kontrollierten Gene führt. Mit der Klonie-rung des 35S-Promotors ergibt sich die Möglichkeit, Transgene in Pfl anzen zur Überexpression zu bringen.
Proteom Die Gesamtheit aller durch ein Genom kodierten Proteine.
Prototrophie Eigenschaft von Stämmen (Mikroben), die auf Minimal-medien, ohne Zusatz von Aminosäuren oder Basen, wachsen können.
Real-Time-PCR Bei der Real-Time-PCR handelt sich um eine Methode der quantitativen PCR, bei der die Menge des entstehenden PCR-Produkts nach jedem PCR-Zyklus gemessen wird. Wird auch als RT-qPCR für Real-Time-quantitative-PCR oder, in Verbindung mit einem reversen Transkripti-ons-Schritt, auch als reverse-Transkriptions-quantitative-PCR bezeichnet.
Rekombination Neukombination von genetischem Material; man unterschei-det:• intrachromosomale Rekombination Allelaustausch zwischen homologen
Chromosomen. Passiert während der Keimzellbildung bei Drosophila nur in Weibchen, nicht in Männchen.
• interchromosomale Rekombination Neukombination von Chromosomen durch die zufällige Verteilung mütterlicher und väterlicher Chromosomen in der ersten meiotischen Teilung auf die Tochterzellen.
Glossar 409
• mitotische Rekombination Tritt als Sonderfall äußerst selten in der Mitose somatischer Zellen auf. Kann auch durch Bestrahlung mit Röntgenstrahlen oder durch das FLP/FRT-System in höherer Frequenz induziert werden.
Reverse-Transkription-PCR (RT-PCR) PCR-basierende Nachweismethode für RNA-Transkripte.
rezessiv Phänotyp zeigt sich nur in homozygoten eukaryotischen Organis-men.
RT-PCR Reverse-Transkription-PCR
Schaukelvektor (shuttle vector) Vektor, der in verschiedenen Wirtssystemen z. B. sowohl E. coli als auch in der Hefe S. cerevisiae, vermehrt werden kann. Der Vektor muss hierzu den charakteristischen Replikationsursprung jedes Wirtes und einen Selektionsmarker für jeden Wirt besitzen.
Segregation Bildung von separaten Phänotypen, die den beiden → Allelen eines Gens entsprechen.
Stamm Ein Stamm besteht aus genetisch einheitlichen Organismen einer Spe-zies, die, wahllos miteinander gekreuzt, nur Organismen mit dem Genotyp der Eltern ergeben. Oder einfacher: Die Nachkommen sehen aus wie ihre Eltern, der Genotyp ist stabil.
temperatursensitiv Mutante, deren Phänotyp in Abhängigkeit von der Tem-peratur ausgeprägt wird. Unter permissiven Bedingungen entspricht das Aus-sehen dem Wildtyp, unter nicht-permissiven Bedingungen (Hitze bzw. Kälte) kommt es dagegen zum Funktionsausfall des Genproduktes.
Tetrade Sie besteht aus vier haploiden Produkten der Meiose. Durch eine post-meiotische Mitose kann die Tetrade aus acht bzw. Vielfachen von vier Sporen bestehen. Grundsätzlich jedoch sind nur vier genetisch verschiedene haploide Genotypen zu unterscheiden.
Tetradenanalyse Die Untersuchung aller vier im Verlauf der beiden meio-tischen Teilungen aus einer diploiden Zelle entstehenden Meiose-Produkte auf ihre genetische Konstitution. Bei einigen Ascomyceten repräsentieren die
Ascosporen eine geordnete Tetrade, die Schlussfolgerungen über die Prä- bzw. Postreduktion eines Allelenpaares erlaubt.
410 Glossar
Transfer-DNA (T-DNA) DNA-Bereich des Tumor-induzierenden Plas-mids von Agrobacterium tumefaciens, der bei der Infektion einer Pfl anzenzelle in das Kerngenom der Pfl anze stabil integriert wird. Die T-DNA wird von spezifi schen Erkennungssequenzen fl ankiert, die als left border (LB) und right border (RB) bezeichnet werden.
Transformation Übertragung von DNA in eine Zelle; man unterscheidet:• biolistische Transformation → Partikelkanone• stabile Transformation mit dem Ziel, transgene Organismen herzustellen,
welche die neu erworbene Erbinformation in jeder Zelle enthalten und an ihre Nachkommen weitervererben.
• transiente Transformation mit dem Ziel, die Erbinformation für einige Zeit in den transformierten Zellen zur Expression zu bringen.
Transkriptom Die Gesamtheit der RNA-Transkripte eines Genoms.
Translokation Chromosomen-Mutationen
Tumor-induzierendes Plasmid (Ti-Plasmid) Autonom replizierte, ringför-mige DNA von Agrobacterium tumefaciens, die alle für die Infektion einer Pfl anzenzelle benötigten Informationen kodiert. Man unterscheidet die vir-Region, welche die Virulenzgene enthält und die Infektion der Pfl anzenzelle sowie die Übertragung und Integration der bakteriellen DNA in das Kernge-nom der Pfl anzenzelle steuert, und die Transfer-DNA (T-DNA)-Region, welche die eigentlich übertragene DNA darstellt.
Größenordnungen
T Tera (1012)G Giga (109)M Mega (106)k Kilo (103)h Hekto (102)c Centi (10–2)m Milli (10–3)µ Mikro (10–6)n Nano (10–9)p Piko (10–12)
Symbole
B MännchenC virginelles WeibchenA Weibchen
Abkürzungen
A Ampere (elektrische Strom-stärke)
A. dest. Aqua destilata (destilliertes Wasser)
bp BasenpaareBq Becquerel (Einheit der Radio-
aktivität; 1 Bq = 1 s–1, also ein Zerfallsereignis pro Sekunde)
cps counts per second (Zählrate, also die Anzahl der gemes-sene Zerfallsereignisse pro Sekunde; die Zählrate ist abhängig vom Messgerät,
dem Abstand zur Probe, deren Form usw. und hat sich trotz der daraus resul-tierenden Ungenauigkeit im Laboralltag eingebürgert)
Da Dalton (Synonym für die Atommasseeinheit; 1 Da = 1/12 der Masse eines 12C-Atoms ≈ 1,66054 ⋅ 10–27 kg)
F Farad (elektrische Kapazität; 1 F = 1 A s /V)
g Erdbeschleunigung (g ≈9,81 m s–2)
g Grammh Stundekb Kilobasenpaare (1 kb =
103 bp)KE Karteneinheit (1 KE = 1 m. u.
= 1 cM)m MeterM mol/L (Molarität)M Morgan-Einheit (1 cM =
1 m. u. = 1 KE)Mb Megabasenpaare (1 Mb =
103 kb = 106 bp)min Minutemol Stoffmenge (Teilchenzahl)
eines Systems, die aus ebenso vielen Elementar-teilchen besteht, wie Atome in 12 g des 12C-Nuklids enthalten sind; die Art der Elementarteilchen (Atome,
Abkürzungen und Symbole
412 Abkürzungen
Moleküle, Ionen, Elektro-nen, Photonen usw.) muss jeweils angegeben werden
m. u. map unit (Karteneinheit; 1 m. u. = 1 KE = 1 cM)
nt (Anzahl) NukleotideL Liter (1 L = 10–3 m3)OD optische Dichte bei einer Wel-
lenlänge von nm (OD =–log10 mit dem Transmis-sionsgrad , dem Verhältnis von durchgelassener zu einfallender Strahlungsleis-tung)
elektrischer Widerstand (1 = 1 V/A)
p. a. pro analysi (lat. „für analyti-sche Zwecke“)
rpm revolutions per minute (Umdre-hungen/min)
RT Raumtemperaturs SekundeU units (Enzymeinheiten)V Volt (elektrische Spannung;
1 V = m2kg s–3A–1)V/m elektrische Feldstärke
(100 000 V/m = 1 kV/cm)
v/v volume per volume (Volumen pro Volumen)
Vol Volumenw/v weight per volume (Gewicht
pro Volumen)
Symbole2µm-Plasmid 393-Aminotriazol (3-AT) 269, 27035S-Promotor 205, 4085-Fluororotsäure (FOA) 161, 1805’-Markierung von Oligonukleotiden
385
AAbdominalsegment 82
Drosophila-Larve 85Aberration, chromosomale 126Ablagegefäß 134accession number 358Acker-Schmalwand. Siehe Arabidopsis
thalianaAcremonium chrysogenum 272, 274,
281, 300, 302Aequorea victoria 43, 134, 195, 325Affi nitätschromatografi e 296Agrobacterium tumefaciens 14, 73, 203Aktivatorstamm. Siehe TreiberstammAlignment 352, 401
globales 353, 401lokales 353, 401multiples 368, 401Signifi kanz 355
Alkohol-Dehydrogenase 312Allel 124, 401
amorphes 125, 401
antimorphes 126, 401dominantes 32DTS- 404gain-of-function. Siehe GOF-GOF- 125hypermorphes 401hypomorphes 401Klassifi zierung 401lacIq- 299LOF- 125loss of function. Siehe LOF-neomorph 401Wildtyp- 32-Aminoadipat 161
AminosäureAustausch 357konservierte 357
Ampicillin 143Analyse, klonale 136Annealing 221Annotation 361, 401Antikörper
2. (Anti-Antikörper) 342-färbung 342spezifi scher 309
Apolysis 78Arabidopsis thaliana 66, 208
Anzucht 70Blüte 118DNA-Transformation 203
Sachverzeichnis
Halbfette Seitenzahlen kennzeichnen Kapitel- und Glossarverweise, kursive Seitenzahlen verweisen auf Abbildungen und Tabellen.
414 Sachverzeichnis
Arabidopsis thaliana (Fortsetzung)Eigenschaften 70Genom 71, 350Genomsteckbrief 66Habitus 69Insertionsmutagenese 73Isolierung von genomischer DNA
210Kartierung mit CAPS-Markern 119Kreuzung
genetische 116Methode 117
Lebenszyklus 68Nachweis der -Glucuronidase-Akti-
vität 332Nomenklatur 72Rekombinationshäufi gkeit 123Stammsammlung 71Systematik 66Transformationsmethoden 205
ARS (autonomously replicating sequence)39
ARS-Element 162Ascospore 402
Neurospora crassa 103Saccharomyces cerevisiae 97Sordaria macrospora 103
Ascus 28, 402Entwicklung 102Neurospora crassa 102Parentaltyp 95postmeiotisch reduziert 104prämeiotisch reduziert 104Rekombinationstyp 95
-rosette 104Saccharomyces cerevisiae 95Sordaria macrospora 102Tetratyp 95
-typNeurospora crassa 103Sordaria macrospora 103
unreif 104Aspergillus awamori 327Aspergillus nidulans 177, 185, 328
Augen-Antennen-Imaginalscheibe 82, 83
Autolysin 193autonomously replicating sequence (ARS)
39Auxotrophie 402
BBAC. Siehe bacterial artifi cial chromo-
someBacillus halodurans 22Bacillus megaterium 22Bacillus subtilis 17
DNA-Transformation 142Element, repetitives 22Genomsteckbrief 18Gesamtgenomsequenz 22Isolierung
von chromosomaler DNA 157von Plasmid-DNA 157
Kompetenz, natürliche 21, 148Lebenszyklus 19Mutante 20Pathogene 19Plasmid 18, 23Selektionsmarker 143Sporulation 20Systematik 17Transformant, Charakterisierung
144Transformation
DNA-vermittelte 21Elektroporation 151Methoden 142
Transkriptionsfaktor A 19Wirtsstamm 143
Bäckerhefe. Siehe Saccharomyces cere-visiae
bacterial artifi cial chromosome (BAC) 15, 63
bait („Köder“) 266, 268Herstellung 283
Bakterium, Zellwandaufbau 2
Sachverzeichnis 415
Balancer 127, 128, 402FM (First Multiple)- 127
-Marker, dominanter 128SM (Second Multiple)- 127TM (Third Multiple)- 127
Basensubstitution 11Basidie 402Bedingung, permissive 407Befruchtungsmodus, autogamer 48Bestäubung 118
-Galactosidase 273, 274, 296, 324,338
Nachweis der Expressiondurch Antikörperfärbung 342im Drosophila-Embryo 339in Imaginalscheiben von Drosophila
341-Glucuronidase (GUS) 205, 324Nachweis der Aktivität in Arabidopsis
thaliana 332-Lactamantibiotikum. Siehe Cephalo-
sporin C-Lactambiosynthesegen (pcbC) 281
Betäubungsplatte 132Betäubungsstation 133Bindungsanalyse 280Bioinformatik 349BLAST (Basic local sequence alignment
tool)-Algorithmus 352, 353,354, 355, 366, 367
Parameter 356BLASTN 362. Siehe auch BLASTBlastoderm 80, 81, 264BLASTX. Siehe BLASTBlau-Weiß-Selektion 144, 324Blumenkohl-Mosaik-Virus (CaMV)
206Blüte 118Blütentransformation 205, 206, 208Bodenbakterium. Siehe Bacillus subtilisbootstrap 369Borste 82Bradford, Proteinbestimmung nach
305
CCaenorhabditis elegans, Genom 350Calciumchlorid-Methode 145Calmodulin-Bindeprotein (CBP) 297CaMV. Siehe Blumenkohl-Mosaik-
VirusCaMV35S-Promotor 205CAPS-Marker 117, 119-Analyse 120
caulifl ower mosaic virus (CaMV). Sie-he Blumenkohl-Mosaik-Virus
CBP. Siehe Calmodulin-BindeproteincDNA-Bank 268Synthese 241
CEN. Siehe CentromerregionCentimorgan. Siehe KarteneinheitCentromer 95-region (CEN) 162
Cephalosporin C 272, 302CFP (cyan fl uorescent protein, cyan fl uo-
reszierendes Protein) 326, 327Chemiluminogramm 311Chlamydomonas reinhardtii 55
DNA-Transformation 193Genom 350Genomsteckbrief 55Gesamtgenomsequenz 63hcf-Phänotyp 61Isolierung von Gesamt-DNA 201Kerngenom 63Kerntransformation 198Kreuzung, genetische 111Kreuzungstyp 57, 58, 60Lebenszyklus 57, 58Linien, vegetative diploide 58Markergene für die Chloroplasten-
transformation 196Mutante 59
Flagellen- 61mbd1 113Photosynthese- 60
Organellengenome 59, 64psaA-Gen 248
416 Sachverzeichnis
Chlamydomonas reinhardtii (Fortset-zung)
Reportergene für die Chloroplasten-transformation 196
RNA-Prozessierung 248Selektionsmarker 195Systematik 55Tetradenanalyse 59, 112, 113Tetradentyp 111Transformant, Charakterisierung
197Transformation
DNA-vermittelte 62Methoden 193
Wirtsstamm 195Chloramphenicol 143Chloroplastentransformation 112
Chlamydomonas reinhardtii 199Chromosomen-Mutation 127, 402cI857-Repressor 295ClustalW 368, 370, 373CO2 132Coenocyt 402complexity fi lter 357, 367conserved domain search 367Contig (contigous sequence) 360Coomassie-Blau 307, 310, 311Cosegregation 123Cosmid 10CPRG 274Crossing-over 97, 102, 103, 165, 403
Doppel- 96, 166Einzel- 166illegitimes 126, 403
Cucumis melo, mitochondriales Genom 350
DDarmbakterium. Siehe Escherichia coliDatenbank 349
dbEST 359EMBL 349EST- 358Gesamtgenom 358, 361
NCBI (GenBank) 349, 356, 358nr (non redundant)- 356
Datenbanksuche, Parameter. Sie-he BLAST, Parameter
DEAE-Membran 280Defi zienz 125, 127, 402Deletion 368, 402Dicer 52Digitalis 260Digoxigenin 260, 284Diplont 32Discosoma spec. 327DNA-Extraktion aus Agarosegel 378
Freeze-and-squeeze-Methode 379mit Phenol 378
-Fällung. Siehe Fällung von Nuklein-säuren
-Isolierungaus Drosophila 218aus Pfl anzengewebe 211Reinheit und Konzentration 155
Phenolisieren 375-Polymerase, thermoresistente 221-Polymorphismus 119-Ring 236-Transformation 141
Arabidopsis thaliana 203Bacillus subtilis 142Chlamydomonas reinhardtii 193Drosophila melanogaster 215Escherichia coli 142Saccharomyces cerevisiae 158Sordaria macrospora 176
DNA-DNA-Hybridisierung 386DNase 241dominant 124, 404Dorsalschluss 81Dot-Blot 144Drosophila-Genetik
Arbeitsplatz 133Grundbegriffe 124
Sachverzeichnis 417
Drosophila melanogaster 75Abdominalsegment
der Adulten 82der Larve 85
Alter 78Augen-Antennen-Imaginalscheibe
82, 83Blastoderm 80, 81, 264Borste 82, 84DNA-Transformation 215Dorsalschluss 81Embryonalentwicklung 79, 81Enhancer-trap-Insertion 337Exoskelett 82Flügel 84Funktionsanalyse von Genen 344Furche, morphogenetische 82, 83Gastrulation 80, 81Gen
Gap- 80maternales 80Paarregel- 80zygotisches 80
Generationszeit 124Generationszyklus 78Genom 350Genomsteckbrief 76Geschlechtskamm 82, 131Geschlechtsmerkmale 82Geschlechtsorgane 82Haltere 84Häutung 80Histoblast 81Imaginalscheibe 81
Entwicklung 83in-situ-Hybridisierung 84, 260Keimbahntransformation 84, 216Keimstreif 80-Verkürzung 80, 81-Verlängerung 80, 81
Komplexauge 82, 83Kopfeinstülpung 81Kreuzung, genetische 124, 132Kutikula-Muster der Larve 85
Larvalentwicklung 80Larve 85Larvenstadium
drittes 78, 80erstes 78zweites 78
Lebenszyklus 78, 79M-Zytotyp 215Makrochaetee 83, 84Mesoderm 80, 264Metamorphose 78Mikrochaetee 83, 84Morphologie der adulten Fliegen
132Notum 83Ommatidium 82, 83P-Element 215P-Zytotyp 215Peripodialmembran 81, 83Photorezeptorzelle 83Puppenstadium 78Scutellum 83Scutum 83Segmentierungsgen 80Segmentpolaritätsgen 80Stammsammlung 16Standardmedium 128Systematik 75Thorakalsegment der Larve 85Thorax 84Unterscheidung der Geschlechter 82,
131Zähnchenband 84, 85Zentralnervensystem (ZNS)-Mittel-
linie 264Zuchtgefäß 129
DsRed-Express (verbessertes DsRed) 327
DsRed (Discosoma red fl uorescent pro-tein) 327
Duplikation 125, 127, 402
EEcdyson 80
418 Sachverzeichnis
Effektorstamm 345, 346EGFP (enhanced green fl uorescent pro-
tein, verbessertes grün fl uores-zierendes Protein) 327, 328
Einfaktorkreuzung 104mit Farbspormutanten 105
ektopisch 189, 229Elektroporation 151, 159Element, repetitives
Bacillus subtilis 22Escherichia coli 13
EMBOSS (European Molecular Biology Open Software Suite) 364
Embryonalentwicklung von Drosophilamelanogaster 79
Endospore 17Endosymbiontentheorie 404enhanced green fl uorescent protein (egfp)
185Enhancer-trap-Experiment 338-Insertion 337
Enterococcus faecalis 23Entwicklung, apandrische 48Enzym 27Epistasie 32, 404Epitop 342Escherichia coli 1, 292, 297, 324
B 298DNA-Transformation 142
Charakterisierung 144Element, repetitives 13Expression, Strategien zur Optimie-
rung 292Expressionsplasmid 301Fusionsprotein 292, 296Genexpression, heterologe 292Genom 350Genomsteckbrief 3Gesamtgenomsequenz 12Isolierung von Plasmid-DNA 157K12 298Konjugation 4, 91, 92Kreuzung, genetische 90
Lebenszyklus 6, 7Mutagenese 11Mutante 10Nomenklatur 10Pathogene 5Plasmid 14Reparaturmechanismen 11Selektionsmarker 143Stammsammlung 16Systematik 3Transformation
Calciumchlorid-Methode 145DNA-vermittelte 12Methoden 142
Transkriptionsfaktor 70 19Verdopplungszeit 6Wachstumskurve 7Wirtsstamm 143, 298
EST. Siehe expressed sequence tagEthylenglykol 159Evolutionsmodell 368Exoskelett 82expect-Wert. Siehe E-Wertexpressed sequence tag (EST) 64, 358,
404Gesamtgenomannotation 361
Expressionektopische
durch das binäre GAL4-System 345
durch induzierbaren Promotor 344in Drosophila 344eines Transgens 347
in Escherichia coli, Strategien zur Optimierung 292
Regulation 313in Saccharomyces cerevisiae, Strategien
zur Optimierung 312Überexpression eines Transgens 347
Expressionsbank 268Expressionsplasmid 292
Escherichia coli 301pCal-n 300
Expressionssystem 291
Sachverzeichnis 419
Expressionsvektor 312pCal-n 300
E (expect)-Wert 355, 356, 404
FF+-Zellen 90F-Faktor. Siehe fertility-FaktorF’-Zellen 90Fällung von Nukleinsäuren 376
mit Ethanol 377mit Isopropanol 377mit Salzen 377selektive F. von RNA 378
Farbspormutante 105FASTA 352
Format 356, 370Fermentation 27fertility (F)-Faktor 90Filter. Siehe complexity fi lterfi rst division segregation. Siehe Präre-
duktionFliegengrab 133Fliegenzucht 128Flipase (FLP) 138. Siehe auch 2µm-
PlasmidFloral-dip-Methode. Siehe Blütentrans-
formationFLP. Siehe FlipaseFLP/FRT-System 138, 404Flügel 84Fluoreszenz 328. Siehe auch Protein,
fl uoreszierendes-Mikroskop 330, 331
FM (First Multiple)-Balancer 127FOA. Siehe 5-FluororotsäureFootprint. Siehe Footprinting-AnalyseFootprinting-Analyse 276Fremd-DNA, Integration 229FRT. Siehe FLP/FRT-Systemfunctional genomics 349, 351, 404Furche, morphogenetische 82, 83Fusionsprotein
Escherichia coli 292, 296Saccharomyces cerevisiae 314
Ggain of function. Siehe GOFGAL4-System 345Gastrulation 80, 81Gefriermethode 159Gelelektrophorese
von DNA 380, 381von Proteinen 306. Siehe auch Poly-
acrylamid-Gelelektrophorese (PAGE)
von RNA 254Gelretentionsanalyse 277, 278, 279,
284, 286. Siehe auch Shift- und Supershift-Western-Blot-Analyse
GenADH1- 312
-Lactambiosynthese- 281ble- 179DsRed- 327DsRed-Express- 327-duplikation 351egfp- 185
Expression in Hyphenpilzen 327,328
eyeless- 348-familie 352Gap- 80gfp- 43, 327gpd- 358, 359, 361, 371, 372gusA- 324lacI- 294, 299lacIq- 302lacZ- 324, 338maternales 80netrinA- 264Paarregel- 80pcbC- 281PGK1- 313psaA- 248PYK1- 313rosy+- 339RTL (reverse transcriptase like)- 318Segmentierungs- 80Segmentpolaritäts- 80
420 Sachverzeichnis
Gen (Fortsetzung)springendes 13white+- 339zygotisches 80
Gen-Centromer-Abstand 105Genbank 10Gene
orthologe 351, 352paraloge 351, 352
Generationszeit 124Genetik
chromosomale Aberrationen als Hilfsmittel 126
Grundbegriffe 124molekulare G., Grundtechniken 375
Genexpression, heterologe 291Escherichia coli 292Saccharomyces cerevisiae 311, 317
gene gun. Siehe PartikelkanoneGenkartierung 31Genom-größen verschiedener Organismen
350mitochondriales G. von Saccharo-
myces cerevisiae 39-sequenz 350-verteidigung 52
GenomsteckbriefArabidopsis thaliana 66Bacillus subtilis 18Chlamydomonas reinhardtii 55Drosophila melanogaster 76Escherichia coli 3Neurospora crassa 44Saccharomyces cerevisiae 26
Genotyp 124Gesamtgenomsequenz
Bacillus subtilis 22Chlamydomonas reinhardtii 63Escherichia coli 12Neurospora crassa 51, 360Saccharomyces cerevisiae 37
Geschlechtskamm 82Geschlechtsmerkmale 82
Geschlechtsorgane 82GFP (green fl uorescent protein, grün
fl uoreszierendes Protein) 134, 325, 326, 327, 348
-Fluoreszenz 329Nachweis in Sordaria macrospora
328Glutathion-S-Transferase (GST) 296GOF (gain of function)-Allel 125Gram-färbung 1-Schnelltest 155
Gruppe-II-Intron 249GST. Siehe Glutathion-S-TransferaseGUS. Siehe auch -Glucuronidase-Test
histochemischer 333photometrischer 335
Gynander 405
HHaemophilus infl uenzae, Genom 350Hakenzelle 102Halo 405Haltere 84Haplont 32Hapten 284Häutung 80hcf. Siehe auch high-chlorophyll-fl uo-
rescence-Phänotyp 61
Hefe 405. Siehe auch Saccharomyces cerevisiae
-chromosom, künstliches. Siehe YACHYBRID-Analyse 266, 273HYBRID-System 265, 267. Siehe
auch ONE-, TWO- und THREE-HYBRID-System
Proteinextrakt-Herstellung 280-transformante, Selektion auf Histidin-
Prototrophie 273-vektor 161, 162, 163, 164. Siehe
auch yeast plasmid, yeast artifi cial chromosome
Sachverzeichnis 421
Heterokaryon 405heterokaryotisch 177heterolog 291Heteroplasmie 198, 405Heterothallismus 405heterozygot 124Heubacillus. Siehe Bacillus subtilisHfr-Zellen 90high-chlorophyll-fl uorescence (hcf)-Phä-
notyp 61, 405high frequency of recombination.
Siehe Hfr-ZellenHistoblast 81Homokaryon 405Homologie 351, 405Homoplasmie 405homoplasmisch 195Homothallismus 405homozygot 124Homo sapiens, Genom 350hph-(Resistenz-)Gen. Siehe Hygromy-
cin-B-ResistenzgenHRP. Siehe Meerrettich-PeroxidaseHumerus-Borste 84Hybridisierung 258
DNA-DNA- 386in-situ- 260
Hybridomabank 342Hybrid Dysgenese 405Hygromycin B 178-Resistenzgen 108, 178
Hyphen 406Hyphenpilz 176, 272
IIFT. Siehe Transport, intrafl agellarerImaginalscheibe 81
Augen-Antennen- 82, 83Entwicklung 83Epithel 83
in-silico-Analyse 284in-situ-Hybridisierung von Drosophila
melanogaster 84inclusion body 291, 296
Indigofarbstoff 324, 325ingroup 368Insertion 368Insertionselement. Siehe IS-ElementInsertionsinaktivierung 146Integration
ektopische 185, 404homologe I. eines Vektors in das
Chloroplasten-Genom von Chlamydomonas reinhardtii 197
Muster 166, 183, 184der T-DNA-Region bei Pfl anzen
203, 204der Vektor-DNA bei Hefe 164, 165,
166der Vektor-DNA bei Hyphenpilzen
182–185, 182, 184, 229Interferenz 276, 406intergenic spacer region (ISR) 22Intron-Konsensus-Sequenz 363Inversion 127, 402inverted-repeat-Sequenz 215IPTG. Siehe IsopropylthiogalactosidIsolierung
von chromosomaler DNAaus Bacillus subtilis 157
von Gesamt-DNAaus Arabidopsis thaliana 210aus Chlamydomonas reinhardtii 201aus Drosophila melanogaster 218aus Hyphenpilzen 188aus Saccharomyces cerevisiae 172
von Plasmid-DNAaus Bacillus subtilis 155aus Escherichia coli 153
von RNA 250aus Algen 251
Isopropylthiogalactosid (IPTG) 294ISR. Siehe intergenic spacer regionIS (Insertions)-Element 13, 22, 90
JJuvenilhormon 80
422 Sachverzeichnis
KKameldung 18Kanamycin 143-Resistenz 302
Kartenabstand bei Saccharomyces cere-visiae 96
Karteneinheit 105Kartierung
mit CAPS-Markern 119einer Mutante 116
Kartoffelacker 56Karyogamie 102Keimbahntransformation 84, 216Keimstreif 80, 264-Verkürzung 80, 81-Verlängerung 80, 81
Kernmatrix 406Kerntransformation 198Klasse-I-Transposon 13Klasse-II-Transposon 13Klonierung 240Klonierungsvektor 15, 143Knock-out-Stamm 108Knospung 28Kompetenz 12
natürliche 17, 21, 148Kompetitionsanalyse 278, 279Komplementationsanalyse 135Komplexauge 82Konidie 406Konjugation 4, 90
Escherichia coli 91, 92Konsensussequenz 294Kopfeinstülpung 81Kopplung 95Kopplungsanalyse 108Kopplungsgrad 119Kopplungsgruppe 406koprophil 46Kosambi-Gleichung 123Kozak-Sequenz 292Kreuzung
Arabidopsis thaliana 117Drosophila melanogaster 132
Einfaktor- 104genetische 89
Arabidopsis thaliana 116Chlamydomonas reinhardtii 111Drosophila melanogaster 124, 132Escherichia coli 90Neurospora crassa 102Saccharomyces cerevisiae 95Sordaria macrospora 102
Neurospora crassa 107Sordaria macrospora 107
Kreuzungstyp 406Chlamydomonas reinhardtii 57, 58,
60Neurospora crassa 46, 47, 104Saccharomyces cerevisiae 28, 29
Kutikula-Muster 85-Präparation 133
LLactococcus lactis 23lac-Operator (lacO) 294LacZ-Test 274LALIGN 363, 364, 365-Expressionsbank 277
Larvalentwicklung 80Larvenstadium
drittes 78, 80erstes 78zweites 78
LebenszyklusArabidopsis thaliana 68Bacillus subtilis 19Chlamydomonas reinhardtii 57Drosophila melanogaster 78, 79Escherichia coli 6, 7Neurospora crassa 46, 47Saccharomyces cerevisiae 28, 29Sordaria macrospora 46, 47
Leserahmen, offener 37letal 407
embryonal- 407larval- 407
Sachverzeichnis 423
Linien, vegetativ diploide 58LOF (loss of function)-Allel 125loss of function. Siehe LOF
MM-Zytotyp 215Makrochaetee 83, 84Maltose-Bindeprotein (MBP) 296map unit. Siehe KarteneinheitMarker, molekularer 117Markergen
Chlamydomonas reinhardtiiChloroplastentransformation 196
Neurospora crassa 179Sordaria macrospora 179
Markierung von Nukleinsäuren 3835’-Markierung von Oligonukleotiden
385Oligo-primed-labelling-Technik 384
MatInspector 367Matrix 357, 407
BLOSUM- 357Maximum Likelihood 369Maximum Parsimony 369MBP. Siehe Maltose-Bindeproteinmcs. Siehe mutiple cloning siteMeconium 131Medium
1/2 MS-Selektionsagar 209BMM- 107CM- 186Drosophila-Standard- 128HS- 114LB- 93, 146, 206LBS- 152SC- 99SD- 99, 169TAP- 115Westergaards 106YEPD- 169YPD- 99
Meerrettich-Peroxidase (HRP) 342-Färbung 343
Meiose 102, 103
meiotic silencing by unpaired DNA (MSUD) 52
Melanin-Biosynthese 109Mesoderm 80, 264Metamorphose 78Mikrochaetee 83, 84Mikromanipulator 29, 31, 97Milbe 131Mitose, postmeiotische 102, 103Modifi zierung, posttranslationale 311Monokultur 131mRNA (messenger RNA) 247MSUD. Siehe meiotic silencing by
unpaired DNAmultiple cloning site (mcs) 164Mus musculus, Genom 350Mutagen 125Mutagenese 125
Escherichia coli 11Saccharomyces cerevisiae 33
Mutanteac (acetate requiring)- 61cw (cell wall)- 59Cy (Curly)- 127Doppel- 31Farbspor- 50Flagellen- 61ftz (fushi tarazu)- 134, 135, 136h (hairy)- 134, 135, 136Identifi kation 133Kartierung 116kni (knirps)- 134, 135konditionale 34, 50mbd1- 113mit–- 34petite- 34pf (paralyzed fl agella)- 62Photosynthese- 60, 250ptc (patched)- 134, 135rho–- 34rho0- 34RIP- 44rosy+ 338ssc (supersecreting)- 317
424 Sachverzeichnis
Mutante (Fortsetzung)temperatursensitive 34, 50, 409wg (wingless)- 134, 135white 77white+ 338
Mutation 11, 32, 85dominant negative 126hypomorphe 125leu2-3,112- 160mitochondriale 34Punkt- 125Rasterschub- 11ura3-52- 160
Mutationstyp 125, 126amorph 126antimorph 126hypermorph 126hypomorph 126neomorph 126
mutiple cloning site (mcs) 143Myzel 407
NNeighbor Joining 368Neomycin-Phosphotransferase.
Siehe Resistenz, Kanamycin-netrinA 262Neurospora africana 372Neurospora crassa 43, 372
Ascus 102Ascustyp 103Farbspormutante 105Genom 350Genomsteckbrief 44Gesamtgenomsequenz 51Kreuzung 107
genetische 102Kreuzungsmedium 106Kreuzungstyp 46, 47, 104Lebenszyklus 46, 47Markergen 179Mutante 50Stammsammlung 16Systematik 44
Tetradenanalyse 49Transformation, DNA-vermittelte
62Neurospora discreta 372Neurospora dodgei 372Neurospora galapagosensis 372Neurospora intermedia 372Neurospora lineolata 372Neurospora pannonica 372Neurospora sitophila 372Neurospora terricola 372Neurospora tetrasperma 372Nicht-Schwesterchromatiden 102Northern-Analyse 248, 257Northern Blot 254Notum 83Nukleinsäure
Fällung 376Markierung 383
5’-Markierung von Oligonukleoti-den 258, 385
Oligo-primed-labelling-Technik 384-Protein-Interaktion 265
in-vitro-Analyse 276in-vivo-Analyse 265
OOligo-dT-Primer 226Oligo-primed-labelling-Technik 384Oligonukleotid
5’-Markierung 385Markierung, radioaktive 258
Ommatidium 82ONE-HYBRID-Analyse
LacZ-Test 274Selektion auf Histidin-Prototrophie
273-System 166, 266, 268, 270, 271
ONPG (o-Nitrophenyl- -D-galacto-sid) 274, 324
Operatorlac- (lacO) 294
Sachverzeichnis 425
Organellengenome in Chlamydomonas reinhardtii 59
Organismusdiploider 124transgener 141. Siehe auch Transfor-
mantOrotidin-5’-Decarboxylase 108Oryza sativa, Genom 350outgroup 368
PP-Element 138, 215-Insertion
genetische Kartierung 218molekularen Kartierung 236
markiertes P-E., Nachweis 216P-Wert. Siehe E-WertP-Zytotyp 215Paarregel-Gen 80PAGE. Siehe Polyacrylamid-Gelelektro-
phoresepaired read 360PAR (photosynthetic active radiation)
70. Siehe auch Strahlung, photo-synthetisch aktive
Partikelkanone (gene gun) 62, 159, 194, 205, 407
PathogeneBacillus subtilis 19Escherichia coli 5
PCR. Siehe PolymerasekettenreaktionPeripodialmembran 81, 83Perithezium 45Pfl anze, transgene
Herstellung 203, 205Segregation 209, 210Selektion 209Selektionsmarker 204Transformation, transiente 205
Pfl anzenanzucht, sterile 209Phage Lambda 8
Expressionsbank 277Vermehrungszyklus 9
Phänotyp 124
Phenolisieren von DNA 375Pheromon 407Phleomycin 179Phosphatase, alkalische 342Phosphoglycerin-Kinase 313Photorezeptorzelle 83Photosynthese-Mutanten von Chlamy-
domonas reinhardtii 60PHYLIP 370Phylogenie-Analyse 367Pigmentzelle 83Plasmid. Siehe auch yeast plasmid, yeast
artifi cial chromosome2µm- 39Bacillus subtilis 18, 23Charakteristikum 14
-DNA, Isolierung aus Bakterien 153Escherichia coli 4, 14low-copy- 90pBC-hygro 181pCRB11 316pFM2 316pGAD424 167pGC1 167pNS2 301pNS3 301pQCIP3 301pQE31 301, 302pREP4 302pSM1 181Tumor-induzierendes (Ti)- 14, 73,
203Plasmodium falciparum, Kern- und
mitochondriales Genom 350Podospora anserina 372Polyacrylamid 306Polyacrylamid-Gelelektrophorese
(PAGE) 300, 306, 310Polyethylenglykol (PEG) 159, 176Polymerase
Fehlerkorrektur 224Pfu- 224Taq- 224
426 Sachverzeichnis
polymerase chain reaction (PCR).Siehe Polymerasekettenreaktion
Polymerasekettenreaktion (PCR) 221,222, 407
inverse 236, 237, 239, 339Kontamination 223lineare 225nested 225Polymerasen 224
-Produkt, Klonierung 240RAPD (random amplifi ed polymorphic
DNA)- 225Real-Time- 226, 227, 241, 408RT (reverse Transkription)- 226,
241, 244, 409Sensitivität 223
Polytänchromosom 84, 126Polzelle 79, 80Population, homoplasmische 195Postreduktion 102, 103, 407Postreduktionsfrequenz 104, 105Präreduktion 102, 103, 408prey („Beute“) 266, 268Primer
Oligo-dT- 226-sequenz 238
Promotor 180, 291, 312, 40835S- 205, 408ADH1- 281Escherichia coli 293heterologe Expression in Saccharo-
myces cerevisiae 313Hitzeschock- 344induzierbarer 294, 344konstitutiver 312kontrollierbarer 294lac- 294, 295lacUV5- 294, 295Lambda pL- 294pcbC- 281, 284T7- 295tac- 294, 295trp- 294, 295
Promotoraktivität
Bestimmung 332in transgenen Reporterpfl anzen von
Arabidopsis thaliana 333proofreading activity. Siehe Polymerase,
FehlerkorrekturProtease, sequenzspezifi sche 293, 298,
299Protein-bestimmung nach Bradford 305fl uoreszierendes
cyan. Siehe CFPgelb. Siehe YFPgrün. Siehe GFP, EGFProt. Siehe DsRed, DsRed-Express
Identifi zierung mittels Immuno-detektion 309
Proteom 408proteomics 351Protoplast 177Protoplastierung 176, 177Prototrophie 35, 269, 408
Histidin- 273psaA-Gen 248, 250-Genexpression 250-trans-Spleißen 249
psbD-mRNA, Stabilisierung der plasti-dären 113
Puparium 78Puppenhülle. Siehe PupariumPuppenstadium 78Pyrococcus furiosus 224Pyruvat-Kinase 313
QqPCR (quantitative PCR). Siehe PCR,
Real-Time-Quelling 44, 52Quencher 228
RRasterschub-Mutation 11RCR. Siehe rolling-circle-Replikation
Sachverzeichnis 427
Rekombination 127, 132, 408heterologe 182homologe 36, 182, 229interchromosomale 408intrachromosomale 403, 408mitotische 136, 137, 409
Rekombinationshäufi gkeit 103Arabidopsis thaliana 123Saccharomyces cerevisiae 96
Rekombinationsprodukt 127Reparaturmechanismen 11repeat-induced point mutation (RIP) 53Replikation
bidirektionale 6Ring-zu-Ring- 14rolling-circle- 14, 23Theta- 7, 9, 14
Reportergen 266, 269, 323-Aktivierung 274
-Glucuronidase (GUS)- 332für Chloroplastentransformation von
Chlamydomonas reinhardtii 196Repressor
cI- 295cI857- 295lacI- 294temperatursensitiver 295
ResistenzAmpicillin- 143Chloramphenicol- 143Hygromycin-B- 178Kanamycin- 143, 302Phleomycin- 179Tetrazyklin- 143
Restriktionsanalyse 380, 381Retrotransposon 314rezessiv 124, 409RFP (red fl uorescent protein, rot fl uores-
zierendes Protein). Siehe DsRedRing-Chromosom 127, 403RIP (repeat-induced point mutation)-
Phänomen 53RNA-Doppelstrang 346
Fällung. Siehe Fällung von Nuklein-säure
Gelelektrophorese 254interference 52, 346Isolierung 250
aus Algen 251messenger (mRNA) 247
-PolymeraseSP6- 262T3- 262T7- 262, 295, 299
-Prozessierung 248ribosomale (rRNA) 247
-Spleißen 265transfer (tRNA) 247Transkriptanalyse 247
RNAi. Siehe RNA interferenceRNase 250rolling-circle-Replikation 14rRNA (ribosomale RNA) 247RT-qPCR (Real-Time-quanti-
tative-PCR). Siehe Poly-merase kettenreaktion, Real-Time-
SSaccharomyces cerevisiae 25, 102, 292.
Siehe auch HefeAscospore 97Ascus 95DNA-Transformation 158Expression, Strategien zur Optimie-
rung 312Fusionsprotein 314Genexpression, heterologe 311, 317Genom 350Genomsteckbrief 26Gesamtgenomsequenz 37Isolierung von Gesamt-DNA 172Kartenabstand 96Kreuzung, genetische 95Kreuzungstyp 28, 29Lebenszyklus 28, 29Mutagenese 33
428 Sachverzeichnis
Saccharomyces cerevisiae (Fortsetzung)Mutante 32Nomenklatur, genetische 32Plasmidvektor 161Promotor zur heterologen Expression
313Rekombinationshäufi gkeit 96Sequenz, repetitive 37Selektionsmarker 160Stammsammlung 43Systematik 25Tetradenanalyse 30Tetradentyp 95Transformant, Charakterisierung
164Transformation
biolistische 159DNA-vermittelte 62Elektroporation 159, 171Gefriermethode 159, 166Lithium-Acetatmethode 159Methoden 142Sphäroplastierungsmethode 159
Wirtsstamm 160Zufallssporenanalyse 98
SAGE (serial analysis of gene expression)349
Salmonella 16Salzfällungs-Methode 219Scaffold 360Schaukelvektor 164, 409. Siehe
auch Shuttle-VektorSchistosoma japonicum 296, 297Schnorchel 133Scutellum 83, 84Scutum 83, 84SDR. Siehe short dispersed repeatSDS-Polyacrylamid-Gel. Siehe Poly-
acrylamid-Gelelektrophoresesecond division segregation. Siehe Postre-
duktionSegmentierungsgen 80Segmentpolaritätsgen 80
Segregation 409Pfl anze, transgene 209, 210
Sekretion 317Selbstbestäubung 116
Verhinderung bei Arabidopsis thaliana117, 118
Selbstung 48Selektion
von Hefe-Transformanten 273negative 161, 180positive 161, 180transgener Pfl anzen 209
SelektionsmarkerBacillus subtilis 143Chlamydomonas reinhardtii 62, 195Escherichia coli 143Pfl anze, transgene 204Saccharomyces cerevisiae 35, 160Sordaria macrospora 178
Selektionsmedium 273Sequenz
homologe 166inverted-repeat- 215Konsensus- 294Kozak- 292repetitive 37Shine-Dalgarno- 292, 293Signal- 317
Sequenzierung 144sex comb. Siehe GeschlechtskammShift 278Shift-Western-Blot-Analyse 279, 280Shigella 16Shine-Dalgarno-Sequenz 292, 293shmoo 28short dispersed repeat 64Shuttle-Vektor 15, 273. Siehe
auch SchaukelvektorpGAD424 167, 167pGC1 167, 167
Signalsequenz 317SM (Second Multiple)-Balancer 127Sordaria brevicollis 372Sordaria fi micola 372
Sachverzeichnis 429
Sordaria macrospora 43, 372Ascus 102Ascustyp 103DNA-Transformation 165, 176Farbspormutante 105GFP-Fluoreszenz, Nachweis 328Integration von Fremd-DNA 229Isolierung von Gesamt-DNA 188Kreuzung 107
genetische 102Kreuzungsmedium 107Lebenszyklus 46, 47Markergen 179Mutante 50Selektionsmarker 178Systematik 44Tetradenanalyse 49Transformant 229
Charakterisierung 176genomische Struktur 230
Transformation 185DNA-vermittelte 62Methoden 177
Wirtsstamm 178Sordaria sclerogenia 372SOS-Antwort 11Southern Blot 165, 173, 184, 382-Analyse von Sordaria-macrospora-
Transformanten 192SP6-RNA-Polymerase 262Sphäroplast 159Spirakel 78Sporenbildung 102Sporenwand 102Sporulation, Bacillus subtilis 20Sporulationsmedium 31Stamm 409
Knock-out- 108transgener, Kopplungsanalyse 108
Stammbaum. Siehe auch tree-Analyse. Siehe Phylogenie-Analyse
Stammsammlung 397Arabidopsis thaliana 71, 75Bacillus subtilis 25
Drosophila melanogaster 77Escherichia coli 16Neurospora crassa 54Saccharomyces cerevisiae 43
Staphylococcus 144Staphylococcus aureus 23, 297STB-Region 162Strahlung, photosynthetisch aktive
(PAR, photosynthetic active radiation) 70
Streptoalloteichus hindustanus 179Streptococcus 144Streptococcus bovis 23Streptococcus faecalis 23Streptomyces avidinii 297Supershift 279-Western-Blot-Analyse 279
Syntenie 361Systematik
Arabidopsis thaliana 66Bacillus subtilis 17Chlamydomonas reinhardtii 55Drosophila melanogaster 75Escherichia coli 3Neurospora crassa 44Saccharomyces cerevisiae 25Sordaria macrospora 44
TT-DNA. Siehe Transfer-DNAT3-RNA-Polymerase 262T7-RNA-Polymerase 262Tag 280, 296, 297
His- 296Tandem-Integration 182Taufl iege. Siehe Drosophila melanogasterTemplate 221Termination 291Terminator 180, 312, 314Tetrade 28, 409
geordnete 102ungeordnete 31, 102
430 Sachverzeichnis
Tetradenanalyse 409Chlamydomonas reinhardtii 59, 112,
113Neurospora crassa 49Saccharomyces cerevisiae 30Sordaria macrospora 49
TetradentypChlamydomonas reinhardtii 111Dityp, parentaler und nicht-parenta-
ler 111Parentaltyp 95Rekombinationstyp 95Saccharomyces cerevisiae 95, 97Tetratyp 95, 111
Tetrahymena 162Tetrazyklin 143Thermoplasma acidophilum, Genom
350Thermus aquaticus 224Theta-Replikation 7, 9, 23Thorakalsegment 85Thorax 84THREE-HYBRID-System 266, 270Ti-Plasmid. Siehe Plasmid, Tumor-
induzierendes-TM (Third Multiple)-Balancer 127trans-Spleißen 248, 249transcriptomics. Siehe functional
genomicsTransfer-DNA (T-DNA) 73, 203, 204,
410Integrationsnachweis 235
TransformantCharakterisierung
Arabidopsis thaliana 203Bacillus subtilis 144Chlamydomonas reinhardtii 197Escherichia coli 144Hyphenpilz 182Saccharomyces cerevisiae 164Sordaria macrospora 176
Hefe-T., Selektion auf Histidin-Pro-totrophie 273
heterokaryotischer 177
Sordaria macrospora-T., genomischeStruktur 230
Überprüfung mit Southern-Blot-Analyse 165
Transformation 410biolistische 62, 112, 159, 205, 212,
410Blüten- 205, 206, 208Calciumchlorid-Methode 145Chlamydomonas reinhardtii
Chloroplasten-T. 199Kern-T. 198
Chloroplasten- 199Co- 180DNA-vermittelte
Bacillus subtilis 21Chlamydomonas reinhardtii 62Escherichia coli 12Neurospora crassa 51Saccharomyces cerevisiae 35Sordaria macrospora 51
Elektroporation 151, 159, 171, 176Gefriermethode 159, 166Hefe 35Hyphenpilz 176Kern- 198Lithium-Acetatmethode 159Methoden
Arabidopsis thaliana 205Bacillus subtilis 142Chlamydomonas reinhardtii 193Escherichia coli 142Saccharomyces cerevisiae 142Sordaria macrospora 177
Protoplastierung 177Saccharomyces cerevisiae 27Sordaria macrospora 185Sphäroplastierungsmethode 159stabile 12, 203, 410
von Pfl anzen 205transiente 12, 203, 410
von Pfl anzen 205, 212Transformationssystem, biolistisches
62
Sachverzeichnis 431
Transkriptase, Reverse 226Transkriptionsfaktor
GAL4 16670 19A 19
Wechselwirkung mit Promotorele-ment 272
Transkriptom 410Translokation 127, 403Transport, intrafl agellarer (IFT) 62,
406Transposase 215Transposition 403Transposon 13, 125, 215
Klasse-I- 13Klasse-II- 13Ty (transposon yeast)- 39
treerooted 371unrooted 371
TREEVIEW 370, 371, 373Treiberstamm 345, 346Trichoderma harzianum 177tRNA 247twin spots. Siehe Zwillingsfl eckenTWO-HYBRID-Plasmid 164-System 266, 269
Ty (transposon yeast)-Element 312, 314
UUAS. Siehe upstream activating sequenceUnterscheidung der Geschlechter bei
Drosophila 82, 131upstream activating sequence (UAS) 345UV-Quervernetzungsexperiment 277
VVektor 216
Hefe- 161, 162, 163, 164Hyphenpilz- 180, 181pFLC-I 262pOT2 262
Vektor-DNA, Mehrfach-Integration 182
Verdopplungszeit 6Vermehrung, vegetative 7Vermehrungszyklus des Phagen
Lambda 9vir-Region 73, 410Virus, temperentes (gemäßigtes) 8Virus-ähnlicher Partikel (VLP, virus like
particle) 314, 315, 316Isolierung 317
Vitellophagenkerne 79VLP (virus like particle). Siehe Virus-
ähnlicher Partikel
WWachstumskurve von Escherichia coli 7Weibchen, virginelles 130Western Blot 300, 308, 311white 77white+ 338Whole-genome-shotgun-Methode 360whole-mount-Verfahren 84, 260Wildtyp 124Wirtsstamm
Bacillus subtilis 143Chlamydomonas reinhardtii 195Escherichia coli 143, 298Saccharomyces cerevisiae 160Sordaria macrospora 178
Wirtszelle, heterologe 291
XX-Gal (5-Bromo-4-chloro-3-indolyl- -
D-galactopyranosid) 324, 325-Färbereaktion 339-Färbung 337
X-Gluc (5-Brom-4-chlor-3-indolyl- -D-glucuronid) 324, 325, 333
YYAC. Siehe yeast artifi cial chromosome
(YAC)YCp. Siehe yeast centromer plasmid
432 Sachverzeichnis
yeast artifi cial chromosome (YAC) 41, 162, 163, 164
yeast centromer plasmid (YCp) 162, 163, 164
yeast episomal plasmid (YEp) 162, 163,164, 165
yeast integrative plasmid (YIp) 162, 163, 164, 165
yeast linear plasmid (YLp) 162, 164.Siehe auch yeast artifi cial chromo-some (YAC)
yeast plasmid 162, 163, 164, 165yeast replicating plasmid (YRp) 162,
163, 164YEp. Siehe yeast episomal plasmidYFP (yellow fl uorescent protein, gelb
fl uoreszierendes Protein) 326, 327
YIp. Siehe yeast integrative plasmidYLp. Siehe yeast linear plasmidYRp. Siehe yeast replicating plasmid
ZZähnchenband 84, 85, 135Zellautonomie einer Genfunktion 136Zellteilung 7Zellwandaufbau 2ZNS. Siehe ZentralnervensystemZentralnervensystem (ZNS)-Mittel-
linie 264Zuchtgefäß 129Zufallssporenanalyse 97, 108
Saccharomyces cerevisiae 98Zwillingsfl ecken 136Zyklus
lysogener 9lytischer 9
Zymolyase 97